| Titre : | Etude de la diversité génétique de quelques palmiers dattier mâles et essai d’identification d’empreintes génétiques de dokkars les plus proches de «Deglet-Nour » moyennant les marqueurs microsatellites |
| Auteurs : | Asma Chaouch Khouane, Auteur ; Halima Benbouza, Directeur de thèse |
| Support: | Thése doctorat |
| Editeur : | Biskra [Algerie] : Université Mohamed Khider, 2022 |
| Langues: | Français |
| Mots-clés: | palmier dattier, diversité génétique, descripteurs morphologiques, microsatellites, UPGMA, STRUCTURE, dokkar. date palm, genetic diversity, morphological descriptors, microsatellites, UPGMA, STRUCTURE, dokkar. |
| Résumé : |
L’étude de la diversité génétique du palmier dattier aussi bien mâles que femelles est une étape indispensable pour la mise en place des programmes de sélections et d’amélioration. Pour ce travail, en plus de l’étude de la diversité génétique des dokkars, notre étude vise à identifier les pollinisateurs génétiquement les plus proches des génotypes femelles appartenant aux importants cultivars commerciaux, principalement ‘Deglet-Nour’ et ‘Ghars’. Dix types de dokkars du palmier dattier nommés selon leurs ressemblances extérieures à des cultivars femelles, un pollinisateur inconnu et deux importants cultivars femelles «Deglet-Nour» et «Ghars» de la région des Zibans ont été caractérisés moyennant des descripteurs morphologiques et des microsatellites. Au total 67 descripteurs de l’IPGRI, du protocole MOCAF de l’AMAP-CIRAD et quelques autres descripteurs de traits quantitatifs proposés par nous-même ont été utilisés pour la caractérisation phénotypique, dont 12 descripteurs pour la partie végétative et 21 pour la partie de reproduction ce sont avérés très discriminants. La caractérisation moléculaire, moyennant 25 microsatellites, a montré une grande variabilité génétique. Le nombre moyen d'allèles amplifiés (135) est élevé avec une hétérozygotie moyenne des loci SSRs (Ho =0.688, He =0.436). Sur les 25 SSR utilisés, la combinaison de deux paires d'amorces ont efficacement séparé six accessions. Nos résultats suggèrent que le marqueur SSR spécifique (MPDCIR35) qui caractérise à la fois les individus mâles et femelles de "Deglet-Nour", pourrait être utilisé comme marqueur potentiel pour sélectionner, à un stade précoce de la plante, le pollinisateur le plus proche de l'individu femelle de ce cultivar. De plus, MPdCIR25 représente un marqueur potentiel pour identifier les accessions de dokkar "Ghars". La caractérisation morphologique et moléculaire suggèrent que les accessions «Deglet-Nour» semblent avoir une base génétique homogène par rapport aux autres accessions, cela pourrait être utilisé comme moyen de certification et de contrôle des produits algériens «Deglet-Nour». La majorité des accessions du dokkar Deglet-Nour semblent être les plus proches du cultivar femelle Deglet-Nour, sur le plan morphologique de la partie végétative et moléculaire, par rapport aux autres accessions étudiées (dokkar/cultivar). Tandis que, les individus mâles et femelles «Ghars» n'étaient pas phénotypiquement proches et avaient des profils génétiques différents et ont été classés séparément. Des cas d’homonymies entre quelques accessions étudiées ont été révélés. Le niveau de similarité obtenu par le dendrogramme UPGMA était compris entre 0.176 à 1, révélant des groupements d’accessions selon l’origine. L'incorporation d'un nombre élevé d'accessions, avec d’autres régions géographiques, et d'autres marqueurs SSRs dans les études génétiques élargira la portée des futures études sur les pollinisateurs du palmier dattier. The study of the genetic diversity of the date palm, both male and female, is an essential step in setting up breeding and improvement programs. For this work, in addition to studying the genetic diversity of dokkars, our study aims to identify the pollinators genetically closest to female genotypes belonging to important commercial cultivars, mainly Deglet-Nour ’and Ghars’. Ten types of date palm dokkars named after their external resemblances to female cultivars, an unknown pollinator and two important female cultivars “Deglet-Nour” and “Ghars” from the Zibans region were characterized using morphological descriptors and microsatellites. A total of 67 descriptors of IPGRI, of the MOCAF protocol of AMAP-CIRAD and some other descriptors of quantitative traits proposed by us were used for the phenotypic characterization, including 12 descriptors for the vegetative part and 21 for the part. of reproduction they have proved to be very discriminating. Molecular characterization, using 25 microsatellites, has shown great genetic variability. The average number of amplified alleles (135) is high with an average heterozygosity of the SSRs loci (Ho = 0.688, He = 0.436). Of the 25 SSRs used, the combination of two primer pairs effectively separated six accessions. Our results suggest that the specific SSR marker (MPDCIR35) which characterizes both male and female individuals of "Deglet-Nour", could be used as a potential marker to select, at an early stage of the plant, the closest pollinator. of the female individual of this cultivar. In addition, MPdCIR25 represents a potential marker to identify accessions of dokkar "Ghars". The morphological and molecular characterization suggest that the “Deglet-Nour” accessions seem to have a homogeneous genetic basis compared to the other accessions., This could be used as a means of certification and control of Algerian “Deglet-Nour” products. The majority of accessions of the dokkar Deglet-Nour seem to be the closest to the female cultivar Deglet-Nour, in terms of the vegetative and molecular part, compared to the other accessions studied (dokkar / cultivar). Whereas, the male and female "Ghars" were not phenotypically similar and had different genetic profiles and were classified separately. Cases of disambiguation between some of the accessions studied have been revealed. The level of similarity obtained by the UPGMA dendrogram ranged from 0.176 to 1, revealing groupings of accessions according to origin. Incorporating a high number of accessions, along with other geographic regions, and other SSR markers into genetic studies will broaden the scope of future date palm pollinator studies. |
Exemplaires (2)
| Cote | Support | Localisation | Disponibilité | Emplacement |
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| TH/2728 | Thèse doctorat | Bibliothèque centrale El Allia | Exclu du prêt | Salle de consultation |
| TH/2728 | Thèse doctorat | Bibliothèque centrale El Allia | Exclu du prêt | Salle de consultation |
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