| Titre : | Contribution à l’étude de l’interaction hôte-pathogène en lien avec les risques épidémiologiques dans la maladie du Bayoud chez le palmier dattier (Phoenix dactylifera L.) dans le sud-est algérien |
| Auteurs : | Laala Djekiref, Auteur ; Mohamed Belhamra, Directeur de thèse |
| Support: | Thése doctorat |
| Editeur : | Biskra [Algerie] : Université Mohamed Khider, 2021 |
| Langues: | Français |
| Mots-clés: | analyse de la structure spatiale, Bayoud, compatibilité végétative, épidémiologie, évolution, Fusarium oxysporum f.sp. albedinis, inoculum, microhabitat, montmorillonite, pouvoir pathogène, sol suppressif. spatial structure analysis, Bayoud, vegetative compatibility, epidemiology, evolution, Fusarium oxysporum f.sp. albedinis, inoculum, microhabitat, montmorillonite, pathogenicity, suppressive soil. |
| Résumé : |
La durabilité de la phœniciculture algérienne est menacée par de multiples perturbations, tout particulièrement par une maladie vasculaire appelée "Bayoud" ; elle est incontestablement la plus redoutable pour les zones phoenicicoles qui en sont indemnes. Les méthodes de lutte, cherchant à atténuer la gravité de cette maladie, par l'utilisation de facteurs biotiques, autres que la résistance intrinsèque de l'hôte, doivent reposer sur des connaissances approfondies portant, d’une part sur l'écologie et la biologie de l’agent causal et d’autre part sur l’épidémiologie de cette maladie et une prise en compte des interactions entre la population hôte et la population parasitaire. Pour scruter cette réflexion, on a suivi dans nos recherches une démarche comparative, entre les microhabitats du pathogène dans des zones contaminées par la maladie et des zones qui en sont indemnes. 67 souches fongiques, isolées à partir d’une trentaine de variétés de palmiers dattiers, situées dans les régions de Adrar, Béchar et Ghardaïa, et 48 échantillons de sol prélevés à partir de 8 palmeraies : 6 infestées par la maladie du Bayoud, situées à Adrar et Ghardaïa, et 2 indemnes, situées à Biskra, ont constitués notre matériel biologique de travail. Les différentes techniques microbiologiques et génétiques, appliquées aux souches du pathogène étudiées, nous ont permis de déterminer certaines caractéristiques physiologiques du Fusarium oxysporum f.sp. albedinis, agent causal de la maladie, affirmer une graduation dans son pouvoir pathogène et une probable diversité génétique au sein de ces souches. Ces caractéristiques risquent de contester certains modes de lutte génétique préconisée par la littérature. L’impact de l’environnement chimique, dans le sol et dans les conditions d’in vitro, sur la croissance et la dynamique de l’inoculum a été prouvé par les analyses des échantillons de sol. La comparaison entre les horizons sains et malades situés dans la même zone atteinte n’a marqué aucune différence. Cependant celle effectuée entre les horizons situés dans une zone atteinte et ceux localisés dans une autre saine a été très concluante. Cinq paramètres (CE, Ca2+, PO4 2- , Mg2+ et CaCO3) semblent être discriminants entre profils sains, situés dans une zone non atteinte, et profils malades, situés dans une zone atteinte. Un lien entre le rôle nutritif de ces éléments chimiques dans les sols des zones saines et son impact sur la résistance des palmiers à la maladie du Bayoud pourrait être établi. La présence de la montmorillonite et de la cristobalite mises en évidence par les analyses minéralogiques, ajoute une autre caractéristique aux microhabitats situés dans les zones saines. La comparaison entre les caractéristiques chimiques et minéralogiques des profils de sol des zones saines et malades, ont tendance d’indiquer qu’il existe une étroite relation entre ces caractéristiques et l’extension de la maladie du Bayoud. Le rôle de ces facteurs abiotiques dans la manifestation du phénomène de suppressivité dans les sols des zones saines est probable. Ces résultats, joints à ceux de l’analyse de la répartition de la structure spatiale de la maladie, constituent des acquis fondamentaux qui devraient nous permettre à mieux comprendre les mécanismes qui gèrent les interactions hôte-pathogène et à évaluer les risques épidémiologiques de cette maladie dévastatrice par l’aptitude de son agent causal à coloniser tel ou tel espace et sa tendance à évoluer. La signification écologique et épidémiologique de certaines données est discutée. The sustainability of Algerian phœniciculture is threatened by multiple disturbances, especially by a vascular disease called "Bayoud"; it is undoubtedly the most formidable for the phoenicultural areas which are free from it. Control methods, seeking to reduce the severity of this disease, by using biotic factors other than the intrinsic resistance of the host, must be based on in-depth knowledge relating, on the one hand, to ecology and biology of the causal agent and on the other hand on the epidemiology of this disease and a consideration of the interactions between the host population and the parasite population. To scrutinize this reflection, we followed in our research a comparative approach, between the microhabitats of the pathogen in zones contaminated by the disease and zones which are free from it. 67 fungal strains, isolated from around thirty varieties of date palms, located in the regions of Adrar, Béchar and Ghardaïa, and 48 soil samples taken from 8 palm groves: 6 infested by Bayoud disease, located in Adrar and Ghardaïa, and 2 unharmed, located in Biskra, constituted our biological working material. The different microbiological and genetic techniques, applied to the strains of the pathogen studied, have enabled us to determine certain physiological characteristics of Fusarium oxysporum f.sp. albedinis, causative agent of the disease, affirm a graduation in its pathogenic power and a probable genetic diversity within these strains. These characteristics may challenge some of the methods of genetic control advocated by the literature. The impact of the chemical environment, in soil and under in vitro conditions, on inoculum growth and dynamics has been proven by analyzes of soil samples. Comparison between healthy and diseased horizons located in the same affected area showed no difference. However, the one carried out between the horizons located in an affected area and those located in another healthy one was very conclusive. Five parameters (CE, Ca2+, PO4 2- , Mg2+ and CaCO3) seem to discriminate between healthy profiles, located in an unaffected area, and diseased profiles, located in an affected area. A link between the nutritive role of these chemical elements in the soils of healthy areas and its impact on the resistance of palms to Bayoud disease could be established. The presence of montmorillonite and cristobalite highlighted by mineralogical analyzes adds another characteristic to the microhabitats located in healthy areas. The comparison between the chemical and mineralogical characteristics of the soil profiles of healthy and diseased areas, tend to indicate that there is a close relationship between these characteristics and the spread of Bayoud's disease. The role of these abiotic factors in the occurrence of the phenomenon of suppressiveness in soils in healthy areas is probable. These results, together with those of the analysis of the distribution of the spatial structure of the disease, are fundamental achievements that should allow us to better understand the mechanisms that manage host- pathogen interactions and to assess the epidemiological risks of this devastating disease by the aptitude of its causal agent to colonize such or such space and its tendency to evolve. The ecological and epidemiological significance of some data is discussed. |
Exemplaires (2)
| Cote | Support | Localisation | Disponibilité | Emplacement |
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| TH/2679 | Thèse doctorat | Bibliothèque centrale El Allia | Exclu du prêt | Salle de consultation |
| TH/2679 | Thèse doctorat | Bibliothèque centrale El Allia | Exclu du prêt | Salle de consultation |
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