Titre : | Morphologie comparée et phylogéographie des barbeaux endémiques du Maghreb, particulièrement en Algérie. |
Auteurs : | Amina Brahimi ; Nacer Tarai, Directeur de thèse |
Support: | Thése doctorat |
Editeur : | Biskra [Algerie] : Université Mohamed Khider, 2018 |
Langues: | Français |
Mots-clés: | Phylogeography, Genetics, Morphology, Barbel, Algeria, Maghreb. Phylogéographie, Génétique, Morphologie, Barbeaux, Algérie, Maghreb. XXIII |
Résumé : |
Dans le Maghreb, les communautés de poissons indigènes (non introduits) sont dominées par les cyprinidés, essentiellement par des espèces de barbeaux endémiques. Certains sont sympatriques et d’autres sont exclusifs dans des habitats particuliers comme les Foggaras en Algérie. Ces espèces présentent des enjeux de conservation importants. Malheureusement, elles restent mal connues, en raison des difficultés pour leur identification : inexactitudes et erreurs qui jouent sur la fiabilité dans les études écologiques et, par conséquent, sur la gestion et la conservation de ces espèces. De ce fait, l’objectif principal de cette thèse est d’approfondir les connaissances fondamentales sur la diversité génétique et la structuration populationnelle, pour déterminer les ressources notamment par l’inventaire moléculaire des espèces et la cartographie de leur répartition. En outre, des considérations taxinomiques et systématiques ont été suggérées dans un contexte d’une approche multidisciplinaire, impliquant des données génétiques, morphologiques, ostéologiques, biologiques et écologiques. Pour comprendre l’histoire évolutive des barbeaux en Afrique du Nord, les relations phylogénétiques ont été étudiées à l’aide de deux marqueurs mitochondriaux (cytochrome b et la Dloop) sur un ensemble de 242 séquences d’ADNmt. D’après nos résultats, 22 espèces valides vivent au Maghreb, dont 19 espèces appartiennent au genre Luciobarbus (tétraploïdes) contre 3 espèces (hexaploïdes) -exclusivement endémiques au Maroc- appartiennent au genre Carasobarbus (2 espèces) et Labeobarbus (une seule espèce). Cette grande diversité génétique au sein du genre Luciobarbus due probablement à une radiation marquée de plusieurs lignées après la crise messénienne (≈ 5,5 millions d’années). En Algérie, la littérature scientifique sur les barbeaux, donne seulement cinq espèces : deux fréquentent les oueds sahariens (Luciobarbus biscarensis et Luciobarbus pallaryi) et trois vivent dans les oueds méditerranéens: Luciobarbus callensis, Luciobarbus leptopogon et Luciobarbus setivimensis. Cependant, grâce à l’analyse génétique et la révision systématique sur 518 spécimens de barbeaux du Maghreb, les résultats actuels montrent la présence de huit espèces dont six sont des lignées méditerranéennes allopatriques. Deux entre eux seront décrites pour la première fois au cours de cette thèse (Luciobarbus chelifensis nov. sp et Luciobarbus mascarensis nov. sp). Dans les régions sahariennes, les analyses génétiques, morphologiques, ostéologiques et biologiques, nous ont permis d’aborder la question de la survie des populations des barbeaux dans les milieux extrêmes, d’une part, et l’évaluation du rôle majeur des glaciations du Quaternaire dans la structuration de l’espace géographique et l’évolution de la diversité génétique d’autre part, en retraçant l’histoire démographique des deux populations isolé és appartenant à l’espèce L. pallaryi dans le bassin du Guir (Algérie). Finalement, une synthèse des différents résultats a permis d’explorer la problématique de conservation des barbeaux endémiques au Maghreb en général et en Algérie en particulier. In the Maghreb, local fish communities are dominated by cyprinids, especially endemic barbels fish. There are some sympatric and others exclusive in particular habitats such as the case of Foggaras in Algeria. Unfortunately, these species are not well known because of the difficulties and the lack of their identification owing to the lack of biological information, inaccuracies and errors in ecological studies and consequently errors in the management and conservation of these species. Therefore, the main objective of this thesis is to deepen fundamental knowledge of this species “ biology and genetic”, in order to determine its resources, in particular by inventorying and mapping on North African barbels, with taxonomic suggestions and systematic in a multidisciplinary approach involving genetic, morphological, osteological, biological and ecological data. To understand the evolutionary history of barbels in North Africa, phylogenetic relationships were studied using two mitochondrial markers (cytochrome b and D-loop) on a set of 242 mtDNA sequences. According to our results, 22 valid species of barbels live in the Maghreb, of which 19 species belong to the genus Luciobarbus (tetraploid) against 3 species (hexaploids). This last group is exclusively endemic of Morocco, including the genus Carasobarbus (2 species) and Labeobarbus (only one species). This great genetic diversity within the genus Luciobarbus is probably due to a marked radiation of several lines after the Messenian crisis (≈5.5My). In Algeria, the scientific literature proves that there are five species of barbels : two are Saharans (Luciobarbus biscarensis and Luciobarbus pallaryi) and three are Mediterranean (Luciobabus setivimensis, Luciobabus leptopogon and Luciobabus callensis). However, through genetic analysis and systematic review of 518 specimens, current results show the presence of 8 species in Algeria with six are allopatric Mediterranean lines. Two of which will be described for the first time (Luciobarbus chelifensis nov. sp and Luciobarbus mascarensis nov. sp). In the Saharan regions, genetic, morphological, osteological and biological analyzes allowed us to discuss the survival of barbel populations in extreme environments on the one hand and the assessment of the major role of Quaternary glaciations in the structuring of the geographical space and the evolution of genetic diversity on the other hand, by tracing the demographic history of the species Luciobarbus pallaryi (Cyprinidae) (n = 52) in the Guir basin (Algeria). Finally, a synthesis of the different results enabled us to explore the conservation problem of the endemic barbels species, in the Maghreb in general and in Algeria in particular. |
Exemplaires (3)
Cote | Support | Localisation | Disponibilité | Emplacement |
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TH/2128 | Thèse doctorat | Bibliothèque centrale El Allia | Exclu du prêt | Salle de consultation |
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