Titre : | Étude de docking moléculaire d'une variété de composés naturels pour le traitement du cancer du sein. |
Auteurs : | Fatma Djahra, Auteur ; Afaf Zekri, Directeur de thèse |
Type de document : | Mémoire magistere |
Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2025 |
Format : | 1VOL.(80.p) / ill.couv.ill.en coul / 30cm |
Langues: | Français |
Langues originales: | Français |
Mots-clés: | Cancer du sein, récepteur ERα, composés naturels, docking moléculaire, ADME, toxicité prédictive, in silico. |
Résumé : |
Ce travail s’inscrit dans le cadre de la recherche de nouveaux inhibiteurs du récepteur des œstrogènes de type α (ERα), une cible majeure dans le traitement du cancer du sein hormono-dépendant. Une étude de docking moléculaire a été menée sur une série de composés d’origine végétale, dans le but d’évaluer leur affinité de liaison au site actif du récepteur. Parmi les molécules testées, deux composés, désignés C1 et C23, ont été sélectionnés sur la base de leurs scores de docking, supérieurs à celui de l’estradiol, ligand endogène de référence. Ces deux candidats présentent une bonne affinité de liaison, avec des interactions stables impliquant les résidus clés du site actif. Les analyses ADME et toxicologiques (SwissADME et ProTox-3) suggèrent une bonne biodisponibilité orale et une faible toxicité prévisible, renforçant leur intérêt en tant que candidats thérapeutiques issus de sources naturelles. |
Sommaire : |
Dédicace................................................................................................................................. I Remerciement ....................................................................................................................... II Résumé : .............................................................................................................................. III Abstract : .............................................................................................................................. III Sommaire ............................................................................................................................ IV Liste des figures ................................................................................................................ VIII Liste des abréviations ............................................................................................................ X Introduction générale : .......................................................................................................... 13 Références bibliographiques : ............................................................................................... 15 Chapitre I Généralités sur cancer du sein .............................................................................. 16 I. le sein ................................................................................................................................ 17 II. Anatomie du sein : ........................................................................................................... 17 III. Le cancer du sein: ........................................................................................................... 18 IV. Type du cancer du sein : ................................................................................................. 19 IV.1 .Cancers in-situ ou non infiltrant : ............................................................................. 19 V. Les facteurs de risque : .................................................................................................... 20 V.1 Facteurs hormonaux endogènes : ................................................................................ 20 V.1 .1 Age précoce des menstruations : ......................................................................... 21 V.1.2 La ménopause tardive : ........................................................................................ 21 V.2. Facteur hormonaux exogènes .................................................................................... 21 V.2.1. Contraceptifs oraux ............................................................................................. 21 V.2.2 Traitement hormonal substitutif (THS) :............................................................... 22 V.3 .Facteurs génétiques, environnementaux, démographiques et sanitaires ...................... 22 V .3.1 Les antécédents familiaux : ................................................................................. 22 V.3.2. Rayonnement ionisantes ...................................................................................... 22 V.3.3 Age : .................................................................................................................... 23 VI . Symptômes : .................................................................................................................. 23 VII . Diagnostic : .................................................................................................................. 24 VII.1 . Circonstances de découverte : ................................................................................ 24 VII.2. Mammographie, échographie .................................................................................. 24 VII.3. La mammographie .................................................................................................. 25 VII.4. Examen clinique ..................................................................................................... 25 VIII .Traitement: .................................................................................................................. 26 VIII.1 La Chirurgie. .......................................................................................................... 26 VIII.1 .1. Chirurgie conservatrice du sein (tumorectomie) : ........................................... 26 VIII.1 .2. Mastectomie totale (chirurgie non conservatrice) :.......................................... 27 VIII.2 La radiothérapie :.................................................................................................... 27 VIII.3 Chimiothérapie : ..................................................................................................... 28 VIII.4 L’hormonothérapie : ............................................................................................... 28 IX. Mécanisme d'action des œstrogènes ................................................................................ 29 X. Oestrogène et cancer du sein ............................................................................................ 30 XI .Anti-œstrogènes : ........................................................................................................... 30 XI .1. Anti-œstrogènes : SERM ......................................................................................... 31 XI .2. Anti-œstrogènes SERD ........................................................................................... 31 Références bibliographiques : ............................................................................................... 33 Chapitre II docking moléculaire ............................................................................................ 37 .Introduction ......................................................................................................................... 38 1. Docking moléculaire: ................................................................................................. 39 2. Principe de docking : ................................................................................................. 39 Types de docking moléculaire : ......................................................................................... 40 1. Le Docking rigide :................................................................................................. 40 2. Docking flexible : ................................................................................................... 41 3. Docking semi-flexible : .......................................................................................... 41 Les outils de docking moléculaire : ................................................................................... 42 2.1. Le récepteur ........................................................................................................ 42 2.2. Ligand : .............................................................................................................. 42 Pharmacocinétique des médicaments : .................................................................................. 43 1. La concentration 50% d’un inhibiteur IC50 : .............................................................. 43 2. Les propriétés ADME : .............................................................................................. 43 2.1 Absorption :………….………………………………………….………………..…..43 2.2 Distribution : …………………………………………………..……………….……44 2.3. Métabolisme : ........................................................................................................ 44 2.4 Elimination : ............................................................................................................ 45 Propriétés physicochimiques : .............................................................................................. 45 Les propriétés « drug-like » sur la base de Lipinski : ......................................................... 45 Règle de Veber ................................................................................................................. 46 Références bibliographique .................................................................................................. 47 Chapitre III Résultat et discussion......................................................................................... 51 I. Introduction : ................................................................................................................. 51 II. Méthodes de calcul : .................................................................................................. 51 II.1. Préparation et optimisation de l’enzyme et des ligands :............................................. 51 II.1.a. Préparation et optimisation du récepteur : ............................................................ 51 II.1.b . Préparation des inhibiteurs ................................................................................. 52 II .2. Exécution du docking moléculaire : .......................................................................... 55 II.3. Prédiction ADMET et biodisponibilité : ..................................................................... 56 III. Résultats et discussion .................................................................................................... 57 III.1 Simulation de Docking moléculaire ........................................................................... 57 III.1.1. Interaction REα–Ligands (enzyme 1: 1G50) :………………………………...…..58 III.2. Évaluation des propriétés ADME : ............................................................................... 67 III.2.1. Propriétés physico-chimiques :...................................................................................67 III.2.2. Analyse des propriétés de chimie médicinale des ligands ciblant ERα......................70 III.2.3. Analyse métabolique approfondie fondée sur le profil de l’estradiol (EST) et le récepteur ERα (PDB : 1G50)....................................................................................................71 III.2.4. Évaluation prédictive de la toxicité des ligands..........................................................73 Références bibliographiques ................................................................................................. 76 Conclusion générale ............................................................................................................. 80 |
Type de document : | Mémoire master |
Disponibilité (1)
Cote | Support | Localisation | Statut |
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MCH/683 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Consultable |