| Titre : | Modélisation moléculaire et conception de nouveaux ligands d'intérêts biologique |
| Auteurs : | Hadil Sellamine, Auteur ; Imane Almi, Directeur de thèse |
| Type de document : | Mémoire magistere |
| Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2025 |
| Format : | 1VOL.(63.p) / ill.couv.ill.en coul / 30cm |
| Langues: | Français |
| Langues originales: | Français |
| Mots-clés: | Maladie d’Alzheimer, butylcholinestérase, docking moléculaire, ADME-T. |
| Résumé : |
La maladie d’Alzheimer est une maladie neurodégénérative insidieuse caractérisée par un déclin progressif de la mémoire qui affecte également le comportement, l’humeur et les émotions. Il n’existe actuellement aucun remède contre la maladie d’Alzheimer, mais les inhibiteurs de la butylcholinestérase peuvent améliorer temporairement les symptômes ou ralentir leur progression. Ce travail consiste à rechercher de nouveaux inhibiteurs de la butylcholinestérase, en utilisant la technologie de docking moléculaire. Cette technologie nous a permis de comprendre les interactions entre trente-trois molécules avec l’enzyme BuChE. D’après les résultats du docking moléculaire, l’évaluation des propriétés ADME et les prédictions de toxicité, le composé L31 présente un profil ADMET favorable et respecte les règles de Lipinski, Veber et Egan. Nous pouvons conclure que (L31) est le meilleur candidat comme inhibiteur pour le traitement des symptômes de la maladie d’Alzheimer. |
| Sommaire : |
Introduction générale ………………………………………………………………………1 Référence bibliographiques ………………………………………………………………..3 I.1. Introduction ……………………………………………………………………………...4 I.2. Généralité sur le liquiritigenine ………………………………………………………...4 I.2.1. Définition …………………………………………………………………………..4 I.2.2. Noyau de base de liquiritigenine …………………………………………………5 I.2.3. Propriétés de liquiritigenine ……………………………………………………...5 I.2.4. Activité biologique de liquiritigenine …………………………………………….6 I.2.5. Synthèse de liquiritigenine ………………………………………………………..6 I.3. La maladie d'Alzheimer ………………………………………………………………...7 I.3.1. Historique ………………………………………………………………………….7 I.3.2. Définition …………………………………………………………………………..9 I.3.3. Physiologie de l’Alzheimer ………………………………………………………..9 I.3.3.1. Lésions extracellulaires (plaques amyloïdes ou plaques séniles) ……..10 I.3.3.2. Lésions intra neuronales (neurofibrillaires) ……………………………10 I.3.4. Les symptômes de la maladie d'Alzheimer …………………………………….11 I.3.5. Le diagnostic de la maladie d'Alzheimer ……………………………………….12 I.3.6. Facteur de risque ………………………………………………………………...13 A) L’âge …………………………………………………………………………..13 B) Le sexe ………………………………………………………………………...14 C) Les gènes ……………………………………………………………………...14 D) Tension artérielle ……………………………………………………………..14 E) Cholestérol ……………………………………………………………………14 F) Autre facteur de risque ………………………………………………………15 I.3.7. Les stades de la maladie d’Alzheimer ………………………………………….15 I.3.7.1. Stades léger ……………………………………………………………….15 I.3.7.2. Stades modéré ……………………………………………………………15 I.3.7.3. Stades avance …………………………………………………………….15 I.4. Conclusion ……………………………………………………………………………...16 Référence bibliographiques ………………………………………………………………..17 II.1. Introduction …………………………………………………………………………...20 II.2. méthodes de modélisation moléculaire ……………………………………………..20 II.2.1. les méthodes quantiques ……………………………………………………….20 II.2.1.1. la théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT) ……………………..21 II.2.1.2. méthode ab initio ………………………………………………………..21 II.2.2. méthodes de semi empiriques ………………………………………………….22 II.2.3. Mécanique moléculaire ………………………………………………………...23 II.2.3.1. Champ de force …………………………………………………………24 II.2.3.2. Différents champs de force en mécanique moléculaire ……………….25 II.3. Docking moleculaire …………………………………………………………………..27 II.3.1. Type de docking moleculaire …………………………………………………..28 II.3.1.1. Docking rigide …………………………………………………………...28 II.3.1.2. Docking flexible …………………………………………………………28 II.3.1.3. Docking semi flexible …………………………………………………...29 II.3.2. Programmes de docking moleculaire …………………………………………29 II.3.3. Principales interaction moléculaires ………………………………………….29 II.3.3.1. Les liaisons hydrogènes ………………………………………………..29 II.3.3.2. Les interactions hydrophobes ………………………………………….30 II.3.3.3. Les interaction de van der walls ………………………………………30 II.3.3.4. Les interactions électrostatique ……………………………………….30 II.4. Dynamique moleculaire ………………………………………………………………31 II.4.1. Principe de la dynamique moleculaire ………………………………………..31 II.5. Pharmacocinétique des médicaments ………………………………………………..31 II.5.1. La concentration 50% d’un inhibiteur IC50 …………………………………31 II.5.2. Propriétés pharmacocinétiques ………………………………………………..32 II.5.2.1. Absorption ………………………………………………………………32 II.5.2.2. Distribution ……………………………………………………………...33 II.5.2.3. Métabolisme ……………………………………………………………..33 II.5.2.4. Excrétion ………………………………………………………………...33 II.5.2.5. Toxicité …………………………………………………………………..33 II.6. Parameters drug-like …………………………………………………………………34 II.6.1. Règle de lipinski ………………………………………………………………...34 II.6.2. Règles de veber …………………………………………………………………34 II.6.3. Règles de ghose …………………………………………………………………35 II.7. Conclusion ……………………………………………………………………………..35 Référence bibliographiques ………………………………………………………………..37 III.1. Introduction ………………………………………………………………………….41 III.2. Matériels et méthodes ………………………………………………………………..42 III.2.1. Matériels ……………………………………………………………………….42 III.2.1.1. MOE …………………………………………………………………….42 III.2.1.2. Biovia Discovery Studio ……………………………………………….43 III.2.1.3. Les banque de donnees ………………………………………………...43 A) Protein Data Bank ………………………………………………….43 B) Pubchem …………………………………………………………….44 III.2.1.4. Les serveurs en ligne …………………………………………………...44 A) Swisse ADME ……………………………………………………….44 B) pkCSM ………………………………………………………………45 III.2.2. Methodologie de calcul ………………………………………………………..45 III.2.2.1. préparation de protéine ………………………………………………..45 III.2.2.2. Preparation des ligands ………………………………………………..46 III.3. Résultats et discussion ……………………………………………………………….47 III.3.1. Simulation de Docking Moleculaire …………………………………………47 A) Interaction : BuChE-Ligands (enzyme : 7Q1N) …………………..47 III.3. 2. Evalution des propriétés ADME …………………………………………….54 A) Propriétés Physico-chimiques ……………………………………..54 B) Propriétés pharmacocinétiques ……………………………………57 Référence bibliographiques ………………………………………………………………..60 Conclusion générale ………………………………………………………………………..62 Annex ………………………………………………………………………………………..63 |
| Type de document : | Mémoire master |
Disponibilité (1)
| Cote | Support | Localisation | Statut |
|---|---|---|---|
| MCH/666 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Consultable |
