| Titre : | Etude QSARA d une serie de benzimidazole a interet pharmaceutique |
| Auteurs : | SAFA NOUHA, Auteur ; Sihem Aggoun, Directeur de thèse |
| Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2024 |
| Format : | 1 vol. (82 p.) / ill., couv. ill. en coul / 30 cm |
| Langues: | Français |
| Langues originales: | Français |
| Mots-clés: | Conception de médicaments, in silico QSAR, SAR, R² adj, R²cv, Q²LOO |
| Résumé : |
Les études quantitatives sur les relations structure-activité (QSAR) et quantitatives (SAR) sont importantes dans les méthodes silico dans la conception rationnelle de médicaments. Le but de ces méthodes est d'optimiser les pistes existantes afin d'améliorer leurs activités biologiques et leurs propriétés physico- chimiques. Également, pour prédire les activités biologiques de composés non testés et parfois encore indisponibles. Le présent travail est basé sur un ensemble de données comprenant 25 composés divers du benzimidazole, le R²cv était de 0,143, le R² adj était de 0,72 et le Q²LOO était de 8,50. En regardant le résultat que nous avons trouvé, nous pouvons conclure que ce modèle est prédictif et robuste. Dans tous les articles mentionnés, les études QSAR constituaient un bon outil de prédiction pour l’étude de l’activité des médicaments.De l'étude de la similarité des médicaments de cette série, nous pouvons conclure que la plupart des résultats sont satisfaisants et peuvent être utilisés. |
| Sommaire : |
Introduction générale .........1 Chapitre I : Recherche bibliographique ..........4 I.1. Introduction .......5 I.2. Généralités sur la benzimidazole ........5 I.2.1. Les tendances actuelles dans les dérivés de benzimidazole ....6 I.2.2. Procédés pour la synthèse de dérivés de benzimidazole ........7 I .2.2.1. Synthèse du 2-alkyle ou aryle de benzimidazoles ...........7 I .2.2.2.Synthèse du 2-benzimidazolyle quinoxaline ...........8 I .2.2.3. Synthèse du 1,2,4-triazino [4,5-a] benzimidazole-1-ones ...8 I .2.2.4. Synthèse de 2-aryl-3- (1H-benzimidazol-2-yl) -5,7-dimethoxyquinolines .....9 I .2.2.5. Synthèse des anilino benzimidazoles .......9 I .2.2.6. Synthèse de 6-hydroxy-(1,3,4)thiadiazolo(2,3-b) benzimidazoles .....10 I .2.2.7. Synthèse de 3-alkyl-thiazolo [3,2-a] benzimidazole ..10 I .2.2.8. Synthèse de alkylbenzimidazoles ....11 I.2.3. Activité biologique des dérivés du benzimidazole .......11 I.2.3.1. Activités antiparasitaire ........11 I.2.3.2. Activités antifongiques ..........12 I.2.3.3. Activités antibactériennes .......13 I.2.3.4. Activités antivirales ............15 I.2.3.5. Activités antiulcéreuses .........16 I.2.3.6. Activités anti-inflammatoires ....17 I.2.3.7. Activités antitumorales ..........18 I.2.3.8. Activités antidiabétiques.........19 I.3. Proprietes Physiques Et Chimiques Des Benzimidazoles ........20 I.3.1. Caracteres Physiques .........20 I. 3.2.Solubilite ...................20 I.3.3. Propriétés Chimiques .........21 Chapitre II : Modélisation Moléculaire .........29 II.1. Introduction ........30 II.2. La modélisation moléculaire ...............30 II.2.1. Les méthodes de la modélisation moléculaire .............30 II.2.2.1. La mécanique quantique ........30 II.2.2.1.1. Approximations LCAO .........31 II.2.2.1.2. Opérateur hamiltonien .........33 II.2.2.1.3. Approximation de Born-Oppenheimer ..........34 II.2.2.1.4. La Fonction D’onde ...............34 II.2.2.2. La mécanique moléculaire (MM) ......35 II.2.2.1. Principe de MM ......35 II.2.2.2. Domaines d’application de la mécanique moléculaire ..........36 II.2.2.3. Les différentes énergies ..............36 II.2.2.4. Quelques champs de force populaire ..........38 II.2.3. Méthode dynamique moléculaire .......39 II.2.3.1. Les méthodes (QSAR) .........39 II.2.3.1.1. Définition.................39 II.2.3.1.2. Principe de QSAR ..........40 II.2.3.1.3. Méthodologie générale d’une étude QSAR ......40 1) Elaborer le modèle .......40 2) Validation du modèle .....40 3) Détermination du domaine d’applicabilité du modèle………………………41 3).1. Elaboration du modèle QSAR .......................41 3).1.a- Base de données ................................41 3).1.b Descripteur moléculaire .........................41 3).2. Descripteurs théoriques ..........................41 II.2.1- Descripteurs empiriques (physico-chimique) .....42 II.2.2- La régression linéaire multiple ................43 II.2.3- La régression non linéaire multiple ............44 II.2.4- La régression des moindres carrés partiels .....44 II.2.5- Surface moléculaire (SAG) .......44 II.2.6- Volume moléculaire (V) ..........45 II.2.7- La réfractivité molaire .........45 II.2.8- La polarisabilité ...............45 II.2.9- Energie d’hydratation ...........45 II.3. Modèles statistiques ..............45 II.4. Domaine d’app1icabi1ité ...........46 Chapitre III : Etude Quantitative Des Relations Structure-Activité (QSAR). III.1. Introduction ............54 III.2. La géométrie moléculaire .................54 III.1.1. Orbitales moléculaires frontières…………………55 III.1.3. Les charges de Mulliken………………………56 III.1.4. Le potentiel électrostatique moléculaire de surface (MESP) ........56 III.3. Étude QSAR à l’aide de descripteurs moléculaires théoriques des dérivés Benzimidazole........57 III.3.1. Méthodologie ..............57 III.3.1.1. Base de données .........57 III.3.1.2. Sélection des descripteurs et méthodes de calcul .......57 III.3.3. Structures chimiques des dérivés de benzimidazole .......58 III.4. Etude des paramètres amphiphiliques de la série de benzimidazole .....61 III.4.1. Drug likeness ........63 III.4.2. Représentation des Calculs « drug-like » sur la base de Lipinski .....64 III.4.3. Les règles de Veber ..........66 III.4.4. Efficacité de ligand « LE » .........67 III.4.5. Efficacité lipophylique de ligand (LLE).......69 III.5. Développement des modèles QSAR ...............72 III.5.1. Equation de quelques paramètres statistique ...........72 III.5.2. Validation d’un model .........73 III.5.3. Les erreurs de prédiction (PE) ..........74 Références Conclusion générale ..........82 |
| Type de document : | Mémoire master |
Disponibilité (1)
| Cote | Support | Localisation | Statut |
|---|---|---|---|
| MCH/631 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Consultable |
