| Titre : | Identification des inhibiteurs naturels de la protéine Neuraminidase du virus de la grippe par Docking moléculaire |
| Auteurs : | kelthoum Yagoub, Auteur ; Mebarka Ouassaf, Directeur de thèse |
| Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2024 |
| Format : | 1 vol. (93 p.) / ill., couv. ill. en coul / 30 cm |
| Langues: | Français |
| Langues originales: | Français |
| Mots-clés: | Protéine neuraminidase, Docking moléculaire, Virus la grippe , DRUG- LIKENESS, ADME-Tox. |
| Résumé : |
La grippe, ou influenza, est une infection virale respiratoire causée par des virus de la famille des Orthomyxoviridae. Les symptômes typiques incluent de la fièvre, des frissons, des maux de tête, des courbatures, une toux sèche, une fatigue intense et des douleurs musculaires La protéine neuraminidase, une composante clé du virus, joue un rôle crucial dans sa réplication et sa propagation dans l'organisme humain. En conséquence, cette protéine représente une cible majeure pour le développement de médicaments antiviraux visant à lutter contre l'infection. Pour la découverte de nouveaux traitements potentiels contre le virus la grippe, la méthode de Docking Moléculaire, utilisant le logiciel Schrödinger, a été employée dans cette étude. Cette approche a permis d'appliquer le criblage de 2175 composés naturels en se focalisant sur le site actif de la protéine neuraminidase (4ks2). Parmi ces composés, seuls 7 composes ont démontré une affinité supérieure à celle du composé de référence (1SJ ), avec un score inférieur à-9.047 kcal/mol. Pour évaluer les propriétés DRUG- LIKENESS et pharmacocinétiques (ADME-Tox) des candidats, des serveurs Web tels que SwissADME et pkCSM ont été utilisés. Ces analyses ont suggéré que trois composés (L5, L6,L7) pourraient représenter des candidats prometteurs en tant qu'inhibiteurs potentiels de la protéine neuraminidase ((4ks2) pour le futur. La grippe, ou influenza, est une infection virale respiratoire causée par des virus de la famille des Orthomyxoviridae. Les symptômes typiques incluent de la fièvre, des frissons, des maux de tête, des courbatures, une toux sèche, une fatigue intense et des douleurs musculaires La protéine neuraminidase, une composante clé du virus, joue un rôle crucial dans sa réplication et sa propagation dans l'organisme humain. En conséquence, cette protéine représente une cible majeure pour le développement de médicaments antiviraux visant à lutter contre l'infection. Pour la découverte de nouveaux traitements potentiels contre le virus la grippe, la méthode de Docking Moléculaire, utilisant le logiciel Schrödinger, a été employée dans cette étude. Cette approche a permis d'appliquer le criblage de 2175 composés naturels en se focalisant sur le site actif de la protéine neuraminidase (4ks2). Parmi ces composés, seuls 7 composes ont démontré une affinité supérieure à celle du composé de référence (1SJ ), avec un score inférieur à-9.047 kcal/mol. Pour évaluer les propriétés DRUG- LIKENESS et pharmacocinétiques (ADME-Tox) des candidats, des serveurs Web tels que SwissADME et pkCSM ont été utilisés. Ces analyses ont suggéré que trois composés (L5, L6,L7) pourraient représenter des candidats prometteurs en tant qu'inhibiteurs potentiels de la protéine neuraminidase ((4ks2) pour le futur. |
| Sommaire : |
Remerciements......2 Dédicace...........1 Introduction Générale .........1 CHAPITRE I : Généralités sur la grippe 1. Introduction .......5 2. Historique de virus de la grippe .........5 3. La structure de Verus la grippe ..........6 4. Caractéristiques et classifications ......7 4.1 Caractéristique .........7 4.2 Classifications .........7 5. Cycle biologique du virus ....8 5.1 Entrée du virus dans la cellule hôte....8 5.2 Libération des ribonucléoprotéines virales (RNPv) dans le cytoplasme ......8 5.3 Transport des RNPv dans le noyau cellulaire .....8 5.4 Transcription et réplication du génome viral ....8 5.5 Assemblage, bourgeonnement et libération des particules virales ....8 6. Protéine neuraminidase ....9 6.1 Définit.........9 6.2 Structure ......9 6.3 L'activité enzymatique de la neuraminidase ............10 6.4 Inhibition naturellement de l’enzyme neutramidase .....11 7. Les médicaments de virus de la grippe ....16 7.1 Le zanamivir ......16 7.2 L’oseltamivir .....17 7.3 Le peramivir ......18 Références bibliographiques .......19 CHAPITRE II: Méthodes de criblage virtuel .1 Introduction ......26 2. Cribage virtuel ...26 2.1 Definition .......26 2.2 But du criblage virtuel .......27 2.3 Les stratégies de criblage virtuel .......28 3. Le Docking moléculaire........29 3.1 Principe ......30 3.2 Les méthodes de Docking moléculaire .....31 3.5 Les étapes de Docking moléculaire .......34 3.6 Logiciels de Dockings moléculaire .......36 4. Les paramètres de "DRUG-LIKNES" .....37 4.1 Règle de LIPINSKI ...37 4.2 Règle de VEBER ......37 5. Filtres ADME-Tox .....38 5.1 Absorption ..........38 5.2 Distribution ........39 5.3 MÉTABOLISME .........40 5.4 Elimination .........41 Références bibliographiques .....45 CHAPITRE III: Matériels et Méthodes 1. Introduction ........53 2. Matériel et outils utilisés ......53 2.1 Micro-ordinateur .........53 2.2 Banques de données et logiciels .....53 3. Methodologies des calculus....57 3.1 Preparations des ligands ....58 3.2 Préparation de la protéine ..58 3.3 Détection de cavité .........59 3.4 Simulation de Docking moléculaire .......60 3.5 Prédiction les propriétés moléculaires des ligands ......60 3.6 Prédictions ADME-Tox propriétés ...61 Références bibliogaphiques ............62 Chapitre IV: Résultats et Discussion 1. Introduction ......66 2. Résultats et discussion ...........66 2.1 Résultats de Dockings moléculaires.........66 2.2 Résultats des propriétés moléculaires (DRUG LIKNESS) ....83 2.3 Résultats des filtres ADME-Tox ......85 2.4 La chimie médicinale ....91 Références bibliogaphiques ..91 CONCLUSION GENERALE .........93 |
| Type de document : | Mémoire master |
Disponibilité (1)
| Cote | Support | Localisation | Statut |
|---|---|---|---|
| MCH/622 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Consultable |
