Titre : | Étude de docking moléculaire d'une nouvelle classe de 1,3,5-triazine |
Auteurs : | Fatima Hamani, Auteur ; Afaf Zekri, Directeur de thèse |
Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2023 |
Format : | 1 vol. (62 p.) / ill., couv. ill. en coul / 30 cm |
Langues: | Français |
Langues originales: | Français |
Mots-clés: | ADME, Docking Moléculaire, 5AK2, Règles de Lipinski et de Veber, MOE. |
Résumé : |
Une étude de docking moléculaire a été réalisée en utilisant le logiciel MOE pour examiner et identifier les interactions entre une nouvelle classe d'inhibiteurs de 1,3,5-triazine et l'enzyme 5AK2. Les propriétés ADME ont été calculées, révélant que tous les composés de la série choisie respectent les règles de Lipinski et de Veber, à l'exception des composés 05,09, 06 et 12. Cela suggère que les autres composés ne présentent aucun problème de biodisponibilité orale. |
Sommaire : |
Introduction générale ...................1 Références bibliographiques .............3 ChapitreI:Généralitésurlecancerdusein....3 I Le cancer ..........4 I.1. Définition ......5 I.2. La classification ......6 I.3. La cancérogenèse .......6 I.3.1. Dépistage du cancer ..6 I.3.2. Les caractéristiques de la cellule cancéreuse ...7 I.3.3. Les étapes de cancérisation.........8 I.4. Les causes du cancer .....9 II. Cancer de sein............10 II.1. Les types de cancer du sein ........12 II.2. Les facteurs de risque de cancer du sein .....12 II.3. Les symptômes du cancer du sein ........13 II.4. Dépistage organisé de cancer du sein ..14 II.5. Le pronostic et l'évolution de cancer du sein ...15 II.6. Traitements ......15 III. Hormonothérapie ...16 III.1. Cancers hormonodependants ......16 III.2. Comment fonctionne l'hormonothérapie ? ......17 III.3. Différents types d'hormonothérapie ....18 III.3.1. Les traitements à base de médicament.....18 III.4. Les anti-œstrogènes .......19 III.4.1. Les types des anti-œstrogènes ......19 Références bibliographiques .......20 CHAPITRE II : ETUDE BIBLIOGRAPHIQUE SUR LE DOCKINGMOLÉCULAIRE .......23 1. Introduction ...........24 2.le développement de docking moléculaire .....24 3.Théorie de base du docking .........25 4. Le principe du docking ............25 5.Type de docking moléculaires .......27 5.1. Le Docking rigide ...............27 5.2. Le Docking flexible .............27 5.3. Docking semi-flexible .......28 6.Les outils du docking moléculaire ................28 6.1. Le récepteur .................................. 28 6.2. Ligand ........................................ 28 6.3. Programme ..................................... 29 7.Etapes de docking moléculaire .................... 30 8. Les algorithmes de recherche .................... 30 8.1. Les algorithmes d'échantillonnage ............. 31 8.1.1. La recherche exhaustive ..................... 31 8.1.2. L'algorithme de Monte Carlo ................. 31 8.1.3. L'algorithme génétique ...................... 31 8.1.4. L'algorithme basé sur les grilles............ 31 8.1.5. L'algorithme de dynamique moléculaire ....... 31 8.2. Fonctions de score ............................ 32 8.2.1. Fonctions de score empirique ................ 32 8.2.2. Les functions, de type knowledge-based ...... 33 9.Interactions protéines-ligands ................... 33 9.1. Mécanisme d’action entre l’enzyme et le substrat ........... 33 9.1.1.ModèledeFisher:Cléserrure.................................. 33 9.1.2- Modèle de Koshland ....................................... 34 9.1.3.ModèledeStrainJenks........................................ 34 9.2. Les différentes interactions ................................35 9.2.1. La liaison hydrogène ..................................... 35 9.2.2. Les interactions de Van Der Walls .........................35 9.2.3. Les interactions hydrophobes: ............................ 36 10.Pharmacocinétique des médicaments .............................36 10.1. La concentration 50% d’un inhibiteur IC50 ..................36 10.2.1. Propriétés physicochimiques................................................... 37 ► Références bibliographiques ..................................... 39 Chapitre III : Résultats et discussion ............................ 42 I. Introduction ................................................... 43 II.1. Préparation et optimisation d’enzyme et des ligands ......... 45 II.1.1. Préparation et optimisation du récepteur .................. 45 II.1.2 Préparation des structures de dérivés de 1, 3,5-triazine ....47 II.2. Etude des propriétés ADME ........................... 49 II.3. Etude de docking moléculaire ........................ 50 III. Résultats et discussions ............................. 50 III.1. Evaluation des propriétés ADME ..................... 50 III.2. Résultats de docking moléculaire ................... 52 IV. Conclusion ........................ 59 ► Références bibliographiques ......... 60 CONCLUSION GENERALE ................... 62 Résumé ................................ 63 |
Type de document : | Mémoire master |
Disponibilité (1)
Cote | Support | Localisation | Statut |
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MCH/607 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Consultable |