Titre : | Conception in silico de nouveaux composés anticancéreux pour le traitement du cancer du sein |
Auteurs : | Dounia Mokrani, Auteur ; Saida Khamouli , Directeur de thèse |
Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2023 |
Format : | 1 vol. (88 p.) / ill., couv. ill. en coul / 30 cm |
Langues: | Français |
Langues originales: | Français |
Mots-clés: | cancer du sein, Récepteur d’estrogène α, Docking Moléculaire, 3D QSAR, ADME-TOX. |
Résumé : |
Le cancer du sein représente un problème majeur de santé publique ; cette maladie constitue la première cause de décès chez les femmes ménopausées. Dans ce travail nous nous sommes intéressé au développement de nouveaux inhibiteurs potentiels de récepteur d’estrogène afin d’enrichir les classes thérapeutiques des médicaments anti-cancer du sein.L’étude de la relation structure activité tridimensionnel a été effectuée sur 28 dérivés de Chromen-2-one, utilisant la méthode de moindre carré partiel (PLS) afin de développer un modèle 3D QSAR significatif. Il a été observé lors de l'utilisation de 3D QSAR de type CoMFA qu'il y avait une forte corrélation entre l'activité expérimentale et prédite, indique la haute qualité du modèle 3DQSAR obtenu. Cette étude a été accompagnée par le docking moléculaire. Nos résultats montrent que les ligands, L25, L26, L27 et L28 sont les meilleurs complexes sélectionnés qui donne la plus faible énergie par rapport au ligand de référence 4-hydroxy Tamoxifene, ensuit les serveurs en ligne tels que SwissADME et pkcsm ont été utilisés pour prédite et analyse les propriétés Drug likeness, et propriétés pharmaco cinétiques, les résultats in silico nous a permis de conclure que le ligand 25 pourrait être un inhibiteur potentiel du récepteur d’estrogène REα. |
Sommaire : |
I.1 Introduction 4 I.2 Anatomie du sein 5 I.3 Le cancer du sein 6 I.4 Les facteurs du risques de cancer du sein 8 I.5 Les symptômes 9 I.6 Diagnostic du cancer du sein 10 I.7 Le traitement 11 I.8 Les récepteurs d’œstrogènes 12 I.8.1 Introduction 12 I.8.2 Définition 13 I.8.3 Types des récepteurs aux œstrogènes et leurs structures 13 I.8.4 Mécanismes d’action des œstrogènes 14 I.8.5 L’œstrogène et le cancer du sein 15 I.8.6 Les anti-estrogènes et modulateurs sélectifs des récepteurs des œstrogènes 16 I.9 Les coumarines 18 I.9.1 Définition 18 I.9.2 Activités biologiques et intérêt des coumarines 19 Références 20 Chapitre II : Aspect théorique et méthodologie II.1 Drug Discovery 23 II.1.1 Historique et développement 23 II.1.2 Les étapes de la découverte des médicaments 24 II.2 Criblage virtuel in silico 26 II.2.1 Définition 26 II.2.2 Les méthodes de criblage 26 II.2.2.1 Criblage virtuel « ligand-based » 27 II.2.2.2 Criblage virtuel « structure-based » 27 II.3 Relation quantitative structure-activité (QSAR) 28 II.3.1 Définition 28 II.3.2 Principe 28 II.3.3 Outils et méthodologie de QSAR 29 II.3.4 Relation structure-activité tridimensionnel 3D 30 II.3.5 Méthodes statistiques 32 II.3.6 Coefficients et tests statistiques 33 II.3.7 Validation du modèle 34 II.3.7.1 Validation interne 34 II.3.7.2 Validation externe 36 II.3.7.3 Tests de randomisation 36 II.3.8 Domaine d’applicabilité 37 II.4 Docking 38 II.4.1 Définition 38 II.4.2 principe 38 II.4.3 Les types de docking 39 II.4.4 Les outils de docking 40 II.4.5 Fonctions de score 41 II.4.6 Algorithme de recherche 42 II.4.7 Interactions moléculaires 43 II.5 ADME-TOX 45 II.5.1 Les propriétés ADME-TOX 45 II.5.1.1 Propriétés physicochimiques 46 II.5.1.2 Propriétés pharmacocinétique et toxicité 46 Référence 48 Chapitre III : Étude 3D-QSAR des dérivés de chromen 2-one III.1 Introduction 54 III.2 Matériels et méthodes 54 III.2.1 Matériels utilisés 54 III.2.2 Méthodologie des calculs 56 III.2.2.1 Base de données 56 III.2.2.2 Minimisation et alignement 59 III.2.2.3 Analyse 3D-QSAR CoMFA 59 III.2.2.4 Validation de modèle 3D-QSAR 59 III.3 Résultats et discussions 60 III.3.1 Modèle 3D-QSAR (CoMFA) 60 III.3.2 Contours Mapp 63 III.3.2.1 Champ stérique 64 III.3.2.2 Champ électrostatique 64 Références 65 Chapitre IV : Étude de docking moléculaire et ADME-TOX des dérivés de chromen 2-one IV.1 Introduction 66 IV.2 Matériels 67 IV.2.1 Les logiciels utilisés 67 IV.2.1 La banque de donnée protéique (PDB) 68 IV.2.3 Les serveurs web de prédiction ADMET 69 IV.3 Méthodologie 70 IV.3.1 Préparation des ligands 72 IV.3.2 Préparation de l’enzyme 72 IV.4 Résultats et discussion 73 IV.4.1 Docking moléculaire 73 IV.4.1.1 Détermination du site actif 73 IV.4.1.2 Les interactions REα -Ligand 74 IV.4.2 Les propriétés ADME-TOX 79 IV.4.2.1 Les propriétés physicochimiques et Drug likeness 80 IV.4.2.2 Les propriétés pharmacocinétiques 81 IV.4.2.2.1 Absorption et distribution 81 IV.4.2.2.2 Métabolisme 82 IV.4.2.3 Prédiction des propriétés toxicologiques 82 Références 85 Conclusion générale 87 |
Type de document : | Mémoire master |
Disponibilité (1)
Cote | Support | Localisation | Statut |
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MCH/601 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Consultable |