| Titre : | Conception par modélisation moléculaire et criblage in silico de nouveaux inhibiteurs de la protéine kinase B. |
| Auteurs : | Mariya Slimani, Auteur ; Saida Khamouli , Directeur de thèse |
| Type de document : | Monographie imprimée |
| Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2023 |
| Format : | 1vol(97) |
| Langues: | Français |
| Mots-clés: | PKB, dérivés de pipéridine ,3D-QSAR, Docking moléculaire, ADMET. |
| Résumé : |
La protéine kinase B (PKB) est une cible thérapeutique prometteuse, qui implique la croissance des cellules cancéreuses. Le but de cette étude est utilisé des méthodes de criblage virtuel, pour diriger la conception de nouvelles molécules potentielles de dérivés de pipéridine pour inhiber la protéine kinase (PKB).
Le modèle 3D-QSAR basés sur le champ a été appliqués à une série de 33 des dérivés de pipéridine. Les résultats statistiques du modèle d’analyse comparative de champ moléculaire (CoMFA) (R2= 0.926, Q2 =0.688) montrent que ce dernier est statistiquement significatif possédant un bon pouvoir prédictif et une bonne stabilité. La validation de modèle a été utilisée pour déterminer la qualité statistique et le pouvoir prédictif de modèle 3D-QSAR.Nous avons utilisé le docking moléculaire sur un ensemble de dérivés de pipéridine comme technique de screening virtuel in silico très employée Les résultats du docking moléculaire ont montré que les ligands L20 et L31 présentent une bonne affinité envers la cible PKB. Le criblage in silico ADMET sont prometteurs pour le ligand L31 pourrait être le meilleur candidat de médicament. |
| Sommaire : |
Remerciement ............. II
Dédicace.................. III Liste Des Figures ........ III Liste Des Tableaux ....... V Liste Des Abréviations ... VI Table Des Matières ....... VIII Introduction Générale..... 1 Références ............... 3 CHAPITRE I : Généralité sur le cancer et la protéine kinase B I.1 Introduction ......... 5 I.2 Définition ........... 5 I.3 Épidémiologie du cancer .............. 6 I.4 Cause de cancer....................... 7 I.5 Caractéristiques du cancer ........... 8 I.6 Les étapes de cancérisation ..........8 I.7 Les différents types de cancer et différentes classifications ..... 9 I.8 Les Symptômes.............. 10 I.8.1 Anxiété et dépression .............. 10 I.8.2 Insomnie ................ 10 I.8.3 Fatigue ................ 11 I.8.4 Douleur ................ 11 I.9 Les facteurs de risqué .......... 11 I.10 Types de traitements............ 12 I.10.1 Chirurgie .................... 12 I.10.2 Radiothérapie ................ 12 I.10.3 Traitements médicamenteux ..... 13 I.11 Protéine kinase B (AKT) .........15 I.11.1 Définition .................... 15 I.11.2 Structure et fonctions......... 16 I.11.3 Le domaine PH activateur/inactivation ..... 17 I.11.4 Inactivation d’Akt ............ 18 I.11.5 Akt et cancer de sein ......... 18 Références ........................... 19 Table des Matières IX | P a g e Chapitre II : Aspects Théorique et Méthodologiques II.1 Drug discovery ........... 25 II.1.1 Histoire de la découverte des médicaments ............ 25 II.1.2 Choix d’un cible thérapeutique .............. 25 II.1.3 Identification des hits ..................... 26 II.1.4 Identification et optimisation de lead ...... 26 II.1.5 Etudes précliniques .............. 26 II.1.6 Etude cliniques .............. 27 II.2 Méthodes de criblage virtuel in silico « Virtuel Screening » ..................... 28 II.2.1 Définition ............... 28 II.2.2 Criblage virtuel ligand-based .......... 29 II.2.3 Criblage virtuel « structure-based » ....... 39 II.3 Docking moléculaire....... 39 II.3.1 Définition ............. 39 II.3.2 Principe du docking............40 II.3.3 Type de docking moléculaires ........ 41 II.3.4 Le processus de docking ........... 42 II.3.5 Les outils du docking moléculaire ......... 44 II.3.6 Algorithmes de recherche ............. 45 II.3.7 Les interactions protéine-ligand .......... 45 II.4 Filtrage ADME-Tox ........... 48 II.4.1 Absorption .......... 48 II.4.2 La distribution ...... 48 II.4.3 Métabolisme......... 48 II.4.4 Elimination......... 49 II.4.5 Toxicologie .......... 49 Références .................. 50 Chapitre III : Matériels et méthodes III.1 Introduction ...... 56 III.2 Matériels utilisées ............. 57 III.2.1 Microordinateur ........ 57 III.2.2 Logiciels utilisés ............ 57 III.2.3 La banque de données protéiques (PDB) ...... 60 III.2.4 SwissA............61 III.2.5 ADMET SAR ............. 61 Table des Matières X | P a g e III.3 Méthodologie des calculs ......... 62 III.3.1 3D-QSAR (CoMFA) ................ 62 III.3.2 Docking Moléculaire ............ 69 III.3.3 Méthodes d’évaluation in silico des propriétés ADME/Toxicité ....... 72 Référence................................ 76 Chapitre IV : Résultats et discussion IV.1 3D-QSAR (CoMFA) ........... 78 IV.2 Docking moléculaire ............ 83 IV.2.1 Les interactions protéine – ligand ........... 83 IV.3 ADMET........... 90 IV.3.1 Propriété physicochimique et Drug likeness ........... 90 IV.3.2 Prédiction des propriétés pharmacocinétiques ……………… 90 IV.3.3 Prédiction des propriétés toxicologique .............. 92 Conclusion Générale .............. 95 Résumé ............ 97 Abstract .......... 97 |
Disponibilité (1)
| Cote | Support | Localisation | Statut |
|---|---|---|---|
| MCH/646 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Consultable |
