| Titre : | Etude combiné de 3D QSAR, criblage virtuel et de docking moléculaire de certains inhibiteurs de CDK4 sélectionnés |
| Auteurs : | Ikram Laouamer, Auteur ; Imane Almi, Directeur de thèse |
| Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2023 |
| Format : | 1 vol. (63 p.) / ill., couv. ill. en coul / 30 cm |
| Langues: | Français |
| Langues originales: | Français |
| Mots-clés: | Discovery studio, CDK4, Docking moléculaire, criblage virtuel, cancer,Pharmacophore. |
| Résumé : |
Les kinases dépendantes de la cycline 4, également connue sous le nom de CDK4, est unecible important pour le traitement du cancer du sein. Dans le but de développer de nouveaux composés ayant un effet inhibiteur supérieur à celui du composé "CDK4" sur la cible CDK4,une enzyme implique dans les tumeurs. Le programme Biovia Discovery studio a été créé dans le but d’assister la conception de molécule ayant une activité thérapeutique. Un criblage virtuel a été réalisé sur une collection de 284176 structures téléchargées à partir de la chimiothéque « NCI ». Parmi ces 284176 structure, 7 composés ont démontrés selon lequel avaient une valeur d’activité estimée inferieur à 0.5 nM .Le modèle pharmacophore utilisé dans le criblage a été généré à partir d’une série de dérivés de pyrido[2,3-d] pyrimidin-7-one. Les règles de Lipinski ont été également utilisées. Grace au logiciel Discovery Studio le docking moléculaire à générer des résultats nous permettant de sélectionner deux meilleurs composés qui pourraient être considérés comme des inhibiteurs prometteurs de notre cible thérapeutique, la CDK4. Enfin, nous avons procédé à une analyse approfondie des interactions spécifiques de cescomposés pour évaluer leur potentiel. |
| Sommaire : |
Introduction générale………………1 Références bibliographique…………..3 Partie 01 : Généralité sur le cancer du sein I.1.1.Introduction........................ 4 I.1.2. Le cancer du sein .................. 4 I.1.2.1. Les caractéristiques d’une cellule cancéreuse .............. 4 I.1.2.2 .Anatomie du sein................ 5 I.1.2.3. Classification du cancer du sein ........... 6 I.1.2.3.1. Classification histologique ..... 6 I.1.2.3.2. Classification moléculaire.............. 7 I.1.2.4. Les facteurs de risques ........... 8 I.1.2.5. Diagnostique ............. 9 I.1.2.6. Le traitement ............ 10 Partie 02 : Généralité sur l’enzyme CDK4 I.2.1. Introduction .............. 11 I.2.2. Le cycle cellulaire ............ 11 I.2.2.1. Les phases de cycle cellulaire ...... 12 I.2.3. Les complexes cyclines-CDKs régulateurs de cycle cellulaire ....... 15 I.2.3.1. Définition de cyclines dépendantes Kinases 4 CDK4 ........ 15 I.2.3.2. La régulation de l’activité de CDK4 .................. 16 I.2.3.3. Le rôle de CDK4 dans le cancer humain ............ 16 I.2.3.4. Les inhibiteurs de CDK4 ........ 17 I.2.3.4.1. Mécanisme d’action des inhibiteurs de CDK4 ...... 18 I.2.3.4.2.Validation des inhibiteurs de CDK4 en tant qu’agent anticancéreux..18 Références bibliographiques ................ 20 Chapitre II : les méthodes de criblage virtuel II.1. Introduction (généralité sur le criblage virtuel)........26 II.2. Le criblage virtuel « ligand-based » ..........27 II.2.1. Recherche de similarité ......27 II.2.2. Méthodes QSAR ..................28 II.2.3. Pharmacophore basé sur le ligand .........28 II.2.3.1.Groupes fonctionnels considérés comme un pharmacophore .......29 II.2.3.2.Modèles pharmacophore 3D .. 30 II.2.3.3. Progrès dans les approches 3D-QSAR (pharmacophore 3D-QSAR) .....31 II.2.3.4. Étude 3D-QSAR ..................31 II.3. Criblage virtuel « structure-based »...31 II.3.1. Conception novo ................32 II.3.2. Modèle pharmacophorique « structure-based » ...........32 II.3.3. RD-QSAR (relation quantitative structure-activité dépendant du récepteur) ....33 II.3.4. docking moléculaire .........33 II.3.4.1. Objectif de docking ..............33 II.3.4.2. Les outils de docking moléculaire ...........34 II.3.4.3. Les type de docking moléculaire ........36 Références bibliographiques ..............38 Chapitre III : résultats et discussion III.1.Introduction ......................43 III.2. Présentation des molécules étudié .......43 III.3. Méthodologie ..........52 III.3.1. Logiciel utilisé ........................52 III.3.2. Collecte et préparation des données .........52 III.4. Résultats et discussion .................53 III.4.1. Génération de modèles pharmacophores .......53 III.4.2. Validation de modèle pharmacophore .....55 III.4.2.1. L’analyse des coûts (cost analysis) ......55 III.4.2.2. L’analyse des ensembles de test ...55 III.4.2.3. Méthodes de randomisation Fischer .....56 III.4.3. Criblage virtuel ......57 III.4.4. Docking moléculaire .....58 Références bibliographiques ......61 Conclusion générale .......63 |
| Type de document : | Mémoire master |
Disponibilité (1)
| Cote | Support | Localisation | Statut |
|---|---|---|---|
| MCH/591 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Consultable |
