| Titre : | Elucidation de l’inhibition de l’Acétylcholinestérase par les méthodes de la modélisation moléculaire |
| Auteurs : | Becha Wafa, Auteur ; Ismail Daoud , Directeur de thèse |
| Type de document : | Monographie imprimée |
| Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2022 |
| Format : | 1 vol. (74 p.) |
| Langues: | Français |
| Mots-clés: | AChE/ BuChE, Dérivés de l’acetazolamide, Docking /Dynamique Moléculaire, ADME, Interactions. Abstract |
| Résumé : |
Notre travail consiste à étudier les interactions entre une série des molécules nouvellement synthétisés (dérivés de l’acetazolamide) et les deux enzymes : l’AChE et le BuChE impliquées dans la maladie d'Alzheimer en utilisant deux méthodes de la modélisation moléculaire (docking et dynamique moléculaire) et un calcul des propriétés ADME. En premier temps, la discussion des résultats de docking moléculaire est basée sur les trois paramètres : énergie de score, RMSD et les types d’interactions formés entre les ligands et les résidus du site actif. En suite, la dynamique moléculaire est utilisée pour la validation des résultats de docking moléculaire et le meilleur ligand obtenus au cours de ces méthodes testé dans le but d’étudier les propriétés physico-chimiques. L’analyse des résultats obtenus montre que le ligand L10 présente une meilleure inhibition de l’AChE et le BuChE, ceci nous a permet de le sélectionner comme étant probablement le meilleur inhibiteur pour ralentir maladie d’Alzheimer. |
| Sommaire : |
I.. Introduction I.1. Méthodes de la modélisation moléculaire I.1.1. Méthodes Quantiques (MQ) a. Méthodes ab-initio (Hartree-fock, Roothan) b. La théorie de la fonctionnelle de densité (DFT) c. Les bases d’orbitales I.1.2 Méthodes Semi Empiriques I.2..1.Mécanique moléculaire a.Terme des atomes liés b.Energie d’interaction entre atomes non liés c.Terme du champ de force d. Différents champs de force en mécanique moléculaire e. Minimisation de l’énergie stérique I.2.3.2. Dynamique moléculaire a. Principe de la dynamique moléculaire b .Calcul de dynamique moléculaire a.Applications de DM I.2.3 Docking Moléculaire a. Protocole Générale de Docking b.Programmes de docking moléculaire I. 3.Définition d’ADME I.3.1.La pharmacocinétique I.3.1.1.Absorption, Distribution, Métabolisme, Elimination (ADME) a) Absorption b) Distribution c) Métabolisme d) Elimination II.1.Introduction II.2. Les protéines II.2.1. Définition des protéines II.2.2. La liaison peptidique II.2.3. Structure des protéines II.2.3.1.Structure primaire II.2.3.2. Structure secondaire II.2.3.3. Structure tertiaire II.2.3.4. Structure quaternaire II.2.4. Les fonctions des protéines II.3. Les enzyme II.3.1 Définition II.3.2. Classification des enzymes II.3.3. Nomenclature II.3.4. Notions de spécificité II.3.5. Le Site Actif II.3.6. Cofacteurs II.3.7. Complexe Enzyme-Substrat (E-S) II.3.8. Inhibition Enzymatique II.3.8.1. Les inhibiteurs réversibles a. Inhibition compétitive b. Inhibition incompétitive (ou anti compétitive) c. Inhibition non compétitive ou mixte II.3.8.2. Les inhibiteurs irréversibles II.3.9. Différentes types cinétiques d’inhibiteurs d’enzymes II.4. Les acides aminés II.4.1. Classification des principaux acides aminés (AA) II.4.1.1. Acides aminés non polaires II.4.1.2. Acides aminés polaires, non chargés II.4.1.3. Non polaires II4.1.4. Les acides aminés aux propriétés particulières II.4.2 Domaines d’utilisation des acides aminés II.4.3 Le rôle biologique des acides aminés a. Le rôle de structure b. Le rôle métabolique c. Les rôles de médiateurs chimiques et de neurotransmetteurs II.5. Introduction II.5.1 Historique. II.5.2 Les causes de MA II.5.3 Les premiers signes d'alerte de l'Alzheimer I. Introduction II . Méthodes de calcul II.1. Préparation et optimisation des enzymes et des ligands II.1.1. Préparation et optimisation du modèle II.1.2. Préparation des inhibiteurs II.2. Docking moléculaire II.3 Propriétés ADME III. Résultats et discussion III.1. Simulation de Docking moléculaire a. Site actif des enzymes b. Validation de la méthode III.1.1. Interaction : AChE–Ligands III.1.2. Interaction : BuChE–Ligands III.2. Dynamique moléculair III.2.1. Complexe AChE–L10 III.2.2. Complexe BuChE–L10 III.3. Évaluation des propriétés ADME II.5.4 Évolution de la maladie d’Alzheimer II.5.5 Les différents facteurs de risques de la MA II.6. Traitement de la maladie d’Alzheimer |
Disponibilité (1)
| Cote | Support | Localisation | Statut |
|---|---|---|---|
| MCH/581 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Empruntable |
