Titre : | Etude par docking moléculaire d’une nouvelle série de 3-(pyrazin-2-yl)-1H-indazoles comme de puissants inhibiteurs de la kinase PIM-1 |
Auteurs : | MILOUDI Khaoula, Auteur ; Afaf Zekri, Directeur de thèse |
Type de document : | Monographie imprimée |
Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2022 |
Format : | 1 vol. (85 p.) |
Langues: | Français |
Mots-clés: | ADME, Docking Moléculaire, Indazole, Règles de Lipinski et de Veber, RMSD. |
Résumé : |
Une étude de docking moléculaire a été effectuée pour étudier et identifier les interactions entre les différents inhibiteurs d’une nouvelle série de 3-(pyrazin-2-yl)-1 H-indazoles et l’enzyme PIM-1 (ID: 4 WRS) à l’aide du logiciel MOE. Les molécules d'eau ont été laissées dans le modèle afin d'assurer un relais entre les ligands et le site actif du récepteur et de créer des réseaux de liaisons hydrogènes. Le calcul des propriétés ADME montre que tous les 30 composés de la série choisie répondent aux règles de Lipinski et de Veber, ce qui suggère que ces composés ne causent aucun problème de biodisponibilité orale. Les composés 13k, 13n, 13p, 18c, 13b et 18l ont des affinités de liaisons élevées et de nombreuses interactions avec l’enzyme PIM-1 (ID : 4WRS) dans la simulation de docking moléculaire. |
Sommaire : |
INTRODUCTION GENERALE Références bibliographiques Chapitre I : Partie (A) : Cancer et Myélome multiple. et Partie (B) : Généralités sur l’enzyme et les kinases PIM-1. Partie (A) : Cancer et Myélome multiple. I. Le cancer I.1. Introduction I.2. Définition I.2.a. Selon l’OMS I.2.b. Selon Larousse de médecine I.3. Épidémiologie du cancer I.4. Les différents types de cancer et différentes classifications : I.5. La cancérogenèse : I.5.a. Propriétés des I.5.b. Les étapes de cancérisation I.5.b.i. Phase d’initiation I.5.b.ii. Phase de promotion I.5.b.iii. Phase de progression : I.6. Les étapes de la transformation cellulaire tumorale I.7. Les causes du cancer : I.8. Traitements du cancer : IV I.8.a. Objectifs du traitement : ............................................................................................. 11 I.8.b. Types de traitement : I.8.b.i. La chirurgie : I.8.b.ii. La radiothérapie : I.8.b.iii. Traitements médicamenteux : I.8.b.iii.1. La chimiothérapie toxique : I.8.b.iii.2. Hormonothérapie : I.8.b.iii.3. Thérapies ciblées : I.8.b.iii.4. Immunothérapie : II. Myélome multiple II.1. Généralités: II.2. Histoire de myélome multiple : II.3. Circonstances de découverte : II.4. Epidémiologie : ................................................................................................................. 19 II.5. Etiologie : Références bibliographiques Partie (B) : Généralités sur l’enzyme et les kinases PIM-1. I. Introduction : II. L’enzyme : II.1. Le Site Actif : II.2. Analyses d'inhibition d'enzymes : II.2.a. Inhibition enzymatique irréversible : II.2.b. Inhibition enzymatique réversible : II.3. Les effecteurs : II.4. Mécanismes des réactions enzymatiques et points clés de l'apprentissage : II.5. L’activité enzymatique : III. Protéines kinases et phosphatases : III.1. Aperçu des voies de signalisation des protéines kinases : III.2. Phosphorylation des protéines et maladie : III.3. Classification des protéines kinases : V IV. Présentation des kinases PIM : IV.1. Structures de kinases PIM : IV.2. Le rôle : IV.3. Structure de PIM-1 : IV.4. Les inhibiteurs de kinases PIM : IV.5. Kinases impliquées dans le déroulement de la différenciation mégacaryocytaire : Les kinases PIM : Références bibliographiques CHAPITRE II : Étude bibliographique sur le docking moléculaire. I. Introduction : 1. Prédiction des propriétés ADME : 1.a. Les propriétés « drug-like » sur la base de Lipinski : 2.b. La règle de Veber : 2. La concentration 50% d’un inhibiteur IC50 : II. Généralité sur le docking : II.1. La première (le docking) II.2. La deuxième (le sco III. Les outils du docking moléculaire : III.1. Ligand : III.2. Récepteur : IV. Programmes de docking les plus cités : V. Type de docking moléculaires : V.1. Docking rigide : V.2. Docking flexible : V.3. Docking semi-flexible : VI. La cible enzymatique : VII. Etape de docking moléculaire : Références bibliographiques VI CHAPITRE III : Resultat et discussion. I. Introduction : II. Méthodes de calcul : II.1. Préparation et optimisation d’enzyme et des ligands : II.1.a. Préparation et optimisation du récepteur: II.1.b. Préparation des structures de dérivés de l’indazole : II.2. Etude des propriétés ADME de dérivés de l’indazole : II.3. Etude de docking moléculaire de dérivés de l’indazole : III. Résultats et discussions : III.1. Evaluation des propriétés ADME in silico de dérivés de l’indazole : III.2. Résultats de docking moléculaire : IV. Conclusion : Références bibliographiques CONCLUSION GENERAL |
Disponibilité (1)
Cote | Support | Localisation | Statut |
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MCH/570 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Empruntable |