Titre : | Etude par modélisation moléculaire des propriétés cytotoxiques de certains dérivés de 1,2-dithiole-3-thione |
Auteurs : | Abboud Faten, Auteur ; Selmi Imane, Auteur ; Nadjib Melkemi, Directeur de thèse |
Type de document : | Monographie imprimée |
Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2022 |
Format : | 1 vol. (66 p.) |
Langues: | Français |
Mots-clés: | Chlordécone réductase, simulations docking/dynamique moléculaire, 1,2-dithiole-3- thiones, ADME, pharmacophore |
Résumé : |
Dans ce manuscrit nous avons réalisé une étude des relations structure/activité cytotoxique d’une série de 19 dérivés de1, 2-dithiole-3-thione. Les composés étudiés sont visés pour être des inhibiteurs de l’enzyme chlordécone réductase (2fvl). Cette étude est basée sur l’utilisation de différente méthode de chimie computationnelle à savoir : simulations de docking/dynamique moléculaire, prédiction des propriétés ADME et étude de pharmacophore. Les résultats des simulations de docking /dynamique moléculaire montrent que les ligands L13, L15 et L16 présentent une bonne affinité de liaison avec les résidus de site actif de l’enzyme chlordécone réductase. Plusieurs interactions sont établaient entre ces ligands et les résidus de site actif à savoir : liaison hydrogène accepteur et les interactions de type Pi-H. Les résultats obtenus de la prédiction des propriétés ADME et Drug-likeness montrent que ces molécules présentent une bonne absorption et une biodisponibilité orale. Finalement, un modèle pharmacophore a été développé, peut être utilisé dans la découverte de nouveaux inhibiteurs de l’enzyme chlordécone réductase. |
Sommaire : |
Introduction générale Chapitre 1 : Les 1,2-dithiole-3-thiones et les mécanismes de détoxification Partie I : Le 1,2-dithiole-3-thione et ces dérivés I. Introduction4 II. Synthèse II.1. A partir de 3-oxoester II.2. A partir des cyclanones II.3. A partir de l’acétophénone II.4. A partir des hydrocarbures saturés avec le soufre II.5. A partir des diènes II.6. A partir des composés aromatiques II.7. A partir des cétones et des aldéhydes II.8. A partir des β- III. Propriétés des dithiolethiones III.1. Propriétés physicochimiques III.2.Les propriétés thérapeutiques des 1,2-dithiole-3-thiones III.3.Propriétés biologiques des dithiolethiones9 III.3 .1 . Propriétés anti oxydantes9 III.3 .2 . Propriétés antimicrobiennes9 III.3.3 : Propriétés anti-hémolytiques10 IV.Réactivité des dithiolethiones10 V.Réactions 10 V.1.Formation des complexes avec les métaux Table des matières V.2.Formation des sels V.3.Réduction V.4.Oxydation VI. Utilisations des dithiolethiones11 VI.1.Pharmaceutiques11 VI.2.Industrielles12 Partie II : Le cancer et les mécanismes de détoxification enzymatiques de Quinone Réductase et Glutathione-S-Transférase I. Introduction II. Mécanisme enzymatique II.1. Le système du glutathion (GSH) 13 II.1.1. La glutathion S-transférase14 II.2.Quinone réductase (QR)14 II.3. Bio activation par NQO141 II.3.1. Réactions de Bio-activation16 II.3.2. Agents anti tumoraux dirigés par enzyme 16 II.4. Mode d’action 17 Références bibliographiques Chapitre 2 : Méthodes de chimie computationnelle utilisées I. Introduction II. Méthodes de chimie théorique II.1. Chimie théorique III. Méthodes de la modélisation moléculaire III.1. Méthodes non Quantiques (empirique) III.2. Mécanique moléculaire III.3. Dynamique moléculaire IV. Docking Moléculaire IV.1. Définition IV.2. Principe de docking IV.3.Protocole Générale de Docking IV.4.Les outils du docking moléculaire IV.5.Docking avec ligand rigide, semi-flexible et flexible IV.5.1.Avec ligand rigide IV.5.2. Avec ligand semi-flexible IV.5.3. Avec ligand flexible V. Définition d’ADME V.1. La pharmacocinétique V.2. Absorption, Distribution, Métabolisme, Elimination (ADME) VI. interactions ligand-récepteur et la modélisation moléculaire Références bibliographiques Chapitre 3 : Résultats et discussion I. Introduction II. Matériels et méthodes II.1.Base de données biologiques II.2. Docking moléculaire II.2.1.Préparation et optimisation de l’enzyme et des ligand II.2.1.1. Préparation de la structure d’enzyme II.2.1.2. Préparation des ligands II.3. Dynamique moléculaire II.4. L’étude in silico des propriétés ADME Résultats et discutions I. Docking moléculaire II. Dynamique moléculaire III. Evaluation des propriétés ADME VI. Génération du modèle pharmacopho VI.1.Groupes fonctionnel considéré comme un pharmacophore VI.2.Sélection et préparation des composés VI.3.Caractéristiques Références bibliographiques Conclusion Générale Annexe |
Disponibilité (1)
Cote | Support | Localisation | Statut |
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MCH/563 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Empruntable |