Titre : | Étude qualitative de la relation structure-propriété et des propriétés "Drug-Like" d'un ensemble de composé à intérêt thérapeutique |
Auteurs : | Messouda Sahnoune, Auteur ; Abla Dif, Auteur ; Afaf Zekri, Directeur de thèse |
Type de document : | Monographie imprimée |
Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2021 |
Format : | 1 vol. (65p.) / ill. / 29 cm |
Langues: | Français |
Résumé : |
Aujourd’hui, la synthèse et la recherche de nouveaux composés chimiques sont souvent associées à une étude par modélisation moléculaire qui est devenue un véritable enjeu. Cette dernière joue un rôle important dans l’optimisation de la structure et permet l’affichage, la simulation, l’analyse, le calcul et le stockage des propriétés moléculaires. Cette modélisation est un ensemble de techniques de calcul basé sur des méthodes et des données expérimentales.Les différentes méthodes de calcul ont été montrées et les résultats des différents calculs ont été présentés et discutés. |
Sommaire : |
INTRODUCTION GENERALE…………………………………………………………..1 REFERENCES……………………………………………………………………………...3 CHAPITRE I : GENERALITE SUR LES FLAVANOIDES I.1. introduction ……………………………………………………………………………..4 I.2. Structure chimique …………………………………………………………….............4 I.3. biosynthèse …………………………………………………………………………….5 I.4. Pharmacologie des flavonoïdes ……………………………………………………......5 I.4.1. Biodisponibilité ……………………………………………………………...........5 I.4.2. Pharmacocinétique ……………………………………………………………......6 I.5. Classification des flavonoïdes ……………………………………………………........6 I.6. Propriété physico-chimiques des flavonoïdes ………………………………………….7 I.6.1. La solubilité des flavonoïdes …………………………………………………......7 I.6.2. Absorption des rayonnements UV ……………………………………………….7 I.6.3. Stabilité des flavonoïdes ………………………………………………………….8 I.7. Inhibition de l'aldose réductase des flavonoïdes …………………………………..........9 I.8.Propriétés biologiques…………………………………………………………………....9 I.8.1. Propriétés anti oxydante des flavonoïdes ……………………………………..........9 I.8.1.1. Stress Oxydant ……………………………………………………………...9 I.8.1.2. Les espèces réactives de l’oxygène ………………………………………..10 I.8.2. Propriétés anticancéreuses …………………………………………………........ ...10 I.8.3. Propriétés anti inflammatoires ………………………………………………….. 11 I.8.4. Propriétés anti radicalaires ……………………………………………………… 11 I.8.5. Propriétés antiallergiques ……………………………………………………...... 12 I.8.6. Propriétés antivirales et antibactériennes ………………………………………... 13 I.9. Autres effets biologiques…………………………………………………………………14 Références…………………………………………………………………………………….15 CHAPITRE II : METHODES DES CALCULES II.1. Introduction…………………………………………………………………………….. 21 II.2. Modélisation moléculaire………………………………………………………....... 22 II.2.1.Les méthodes de la modélisation moléculaire………………………………...... 22 II.2.1.1.La mécanique quantique (MQ)………………………………………...... .22 II.2.1.1.1.L’approximation de Born-Oppenheimer………………………...... 23 II.2.1.1.2.Approximations orbitales………………………………………….. 24 II.2.1.1.3. Approximations LCAO………………………………………….... 24 Les méthodes ab initio ………………………………………...………….......... .25 DFT (La théorie de la fonctionnelle de la densité)…………………………….... 25 Les méthodes semi-empiriques………………………………………………….. 26 II.2.1.2.La mécanique moléculaire………………………………………………...... .27 II.2.1.2.1.Les différentes énergies……………………………………………...... 28 II.2.1.2.1.1.Énergie d’interaction entre atomes liés……………………......... 28 Énergie d’élongation (stretching)……………………………………………........ 28 Énergie bending………………………………………………………………….... 28 Énergie de torsion……………………………………………………………….... .28 II.2.1.2.1.2.Énergie d’interaction entre atomes non-liés…………………....... .28 Énergie de van der waals………………………………………............................. 28 Énergie des électrostatiques……………………………………………………...... 29 II.2.1.2.2.Le champ de force……………………………………………….…... 29 II.2.1.3.Dynamique moléculaire…………………………………………..…………… 30 II.2.Relation Qualitative Structure Activité……………………………………………...... 31 II.2.1.Définition………………………………………………………………..………... 31 II.2.2.Paramètres biologiques………………………………………………………...... ..31 II.2.3.Descripteurs moléculaires………………………………………………………… 32 II.2.3.1.Descripteurs 1D ……………………………………………………………. 32 II.2.3.2.Descripteurs 2D…………………………………………………………….33 II.2.3.3.Descripteurs 3D…………………………………………………………..... .33 II.2.3.4.Descripteurs constitutionnels………………………………………………. .34 II.2.3.5.Descripteurs topologiques…………………………………………………. 34 II.2.3.6.Descripteurs géométriques……………………………………………….... 35 II.2.3.7.Descripteurs physicochimiques…………………………………………..35 II.2.3.8.Descripteurs électroniques……………………………………………….36 II.2.3.9. Importance des descripteurs……………………………………………..36 II.2.4.Les applications de QSAR……………………………………………………….37 Références………………………………………………………………………………38 CHAPITRE III : Étude qualitative de la relation structure-activité d'une série des dérivés de flavonoïde III.1.introduction……………………………………………………………………………..44 III.2.propriétés QSAR caractérisant la structure moléculaire ……………………………... 44 III.1.2.1.Les paramètre physico-chimique …………………………………………….. 44 Le coefficient de partage octanol/eau..…….….…………………………………….. 44 Le volume moléculaire ………………………………………………………………45 Le poids moléculaire……………………………………………………………….....45 L’énergie d’hydratation……………………………………………………………….45 Polarisabilité…………………………………………………………………………..45 Réfractivité…………………………………………………………………………....46 III.3.propriétés ADME ……………………………………………………………………....46 III.3.1.Règle de Lipinski …………………………………………………………………46 III.3.2. Règle de veber ……………………………………………………………………47 III.4 .Matériels et méthodes………………………………………………………………..... .48 III.5.Résultats et discussions………………………………………………………………… 55 III.5.1.Étude des propriétés QSAR de la série des dérivés de Flavonoïde……………….. 55 III.5.2. Étude des propriétés ADME …………………………………………………......58 III.5.2.1. Étude de la règle de Lipinski ………………………………………………..58 III.5.2.2. Étude de la règle de Veber……………………………………………….60 Référence……………………………………………………………………………………. .63 Conclusion général……………………………………………………………………………65 |
Type de document : | Mémoire master |
Disponibilité (1)
Cote | Support | Localisation | Statut |
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MCH/538 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Consultable |