| Titre : | Modélisation moléculaire pour la découverte de nouveaux inhibiteurs de caspase-3. |
| Auteurs : | AMRA INES ROUABEH, Auteur ; OUM HANI YAGOUB, Auteur ; Mebarka Ouassaf, Directeur de thèse |
| Type de document : | Monographie imprimée |
| Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2021 |
| Format : | 1 vol. (161 p.) / couv. ill. en coul / 30 cm |
| Langues: | Français |
| Mots-clés: | Mots clés : Docking moléculaire - Caspase-3-Le score-Les dérivés de 1, 2- benzisothiazole-3-one |
| Résumé : |
Avec le développement des outils informatiques au cours des 20 dernières années, la modélisation moléculaire et l'amarrage moléculaire plus précis sont entrés très rapidement dans le domaine de la recherche sur les médicaments. L'objectif de notre travail est de contribuer au développement de nouveaux inhibiteurs de la Caspase-3 en utilisant Docking moléculaire pour simuler les interactions enzyme-inhibiteur. Nous nous basons spécifiquement sur deux paramètres : le score énergétique et la distance d'interaction entre le ligand et le résidu du site actif. L'analyse des résultats obtenus a montré que six composés dérivés 1, 2- benzisothiazole-3-one sont L25, L42, L47, L49, L50 et L51. Ils ont un meilleur effet inhibiteur, ce qui nous permet de les choisir ces derniers comme étant de nouveaux inhibiteurs potentiels de la Caspase3. |
| Sommaire : |
Liste des Figures ……………………..............................i
Liste des Tableaux................................................ii Liste des abréviations ……………………………………………….......….iii Introduction générale ..................................1 Références bibliographiques Chapitre1 : Généralités sur les Caspase 1.1. Introduction .........................................4 1.2. Nomenclature ......................................................................4 1.3. Classification ....................................................4 1.4. Structure de caspase.........................................6 1.5. Substrats des caspase...........................................................7 1.6. Rôles des caspases.....................................................9 1.6.1. Dans l’apoptose ..........................................................9 1.6.2. Dans d’autres processus ..................................................12 1.7. Régulation des caspases..................................................................15 1.7. 1. IAPs ...............................................................15 1.7. 2. FLIP ...................................................................15 1.7. 3. La phosphorylation.................................................................16 1.7. 4. Les calpaïnes ....................................................................1 1.7. 5. CrmA et P35 et p49 .....................................................16 1.8. caspase indépendante..............................................................17 Références bibliographiques ......................................................18 Chapiter2 : Docking Moléculaire 2.1. Introduction ......................................................................24 2.2. Le Docking Moléculaire...................................................................24 2.3. Les outils du Docking moléculaire...................................................25 2.3.1. Ligand...............................................................................25 2.3.2. Récepteur ..................................................................26 2.4. Les interactions Protéine-Ligand.........................................................27 2.4.1. Les interactions électrostatiques ...............................................................27 2.4.2. La liaison hydrogène ..........................................................................28 2.4.3. Les interactions de Van Der Walls .............................................................28 2.4.4. Les interactions hydrophobes .................................................28 2.5. Processus de scoring........................................................................29 2.5.1. Principe....................................................29 2.5.2. Description des fonctions de scoring uti...............................29 2.6. Protocole Générale de Docking ............................................................31 Références bibliographiques.............................................................33 Chapitere3 : Applications, Résultats et Discussions 3.1. Introduction................................................................................36 3.2. Matériel et outils utilisés................................................................36 3.2.1. Micro-ordinateur............................................................................36 3.2.2. Logiciel utilisé ........................................................................36 3.3. Le Protocole d’étude ....................................................................38 3.3.1. Préparation de récepteur ........................................................39 3.3.2. Préparation des ligands..................................................................40 3.3.3. Détection des cavités.........................................................43 3.3.4. Etude de Docking moléculaire...............................................................45 3.4. Résultats .......................................................................45 3.4. 1. Etude des interactions enzyme-ligand de référence................................47 3.4. 2. Etude des interactions enzyme-ligand......................................................48 3.5. Discussion.........................................................................55 Références bibliographiques........................................................58 Conclusion Générale Résumé Abstract |
| Type de document : | Mémoire master |
Disponibilité (1)
| Cote | Support | Localisation | Statut |
|---|---|---|---|
| MCH/525 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Consultable |
