Titre : | Etude 2D-QSAR DE Dérivés de benzophénone en tant qu’agents antipaludique |
Auteurs : | Naouel Kedidi, Auteur ; Kamilia Guebbabi, Auteur ; Mebarka Ouassaf, Directeur de thèse |
Type de document : | Monographie imprimée |
Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2020 |
Format : | 1 vol. (77 p.) / couv. ill. en coul / 30 cm |
Langues: | Français |
Mots-clés: | QSAR ; MLR ; MNLR ; Inhibiteurs de la PFT ; benzophénone ; antipaludique |
Résumé : |
Dans ce travail, une relation quantitative structure-activité (QSAR) a été réalisée pourprédire les activités inhibitrices de la protéine farnésyltransférase (PFT) pour une série de 35dérivés de benzophénone. L'ensemble de données a été divisé en deux sous-ensembles l'ensemble d'apprentissage et de test, les modèles MLR et MNLR ont montré des paramètres de validation internes et externes satisfaisants (R 2 ajusté = 0.896, R 2test=0.909) et (R 2 ajusté = 0.757, R 2 test = 0.914) qui ont passé les critères d'acceptabilité du modèle. Les modèles ont été validés rigoureusement grâce à une validation croisée. En outre, la puissance prédictive externe du modèle proposé a été examinée en tenant compte, des critères de modèle acceptables de Golbraikh, Le domaine d'applicabilité des modèles a été soigneusement défini à l'aide du graphique de Williams. Les modèles montrent que les activités antipaludiques de la benzophénone dépendent des descripteurs logP, bpol, MAXDn et FMF, Ces indicateurs peuvent être utilisés pour concevoir de nouveaux inhibiteurs de la benzophénone PFT et prédire la valeur de leurs activités antipaludiques sur la base des équations MLR et MNLRQSAR. |
Sommaire : |
DEDICACE.............................................................................................................................. A DEDICACE..................................................................... REMERCIEMENTS............................................................................................................... C TABLEAU DES MATIERES ................................................................................................ D LISTE DES TABLEAUX ....................................................................................................... E LISTE DES FIGURES.............................................................................................................F LISTES DES SCHEMAS ........................................................................................................F INTRODUCTION GENERAL :............................................................................................... 2 REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES : .............................................................................. 5 CHAPITRE I RAPPELS BIBLIOGRAPHIQUE SUE LES ANTIPALADIQUE ................... I. LE PALUDISME .................................................................................................................. 7 1. INTRODUCTION :.............................................................................................................. 7 2. DEFINITION DE PALUDISME :...................................................................................... 9 3. AGENT PATHOGENE :..................................................................................................... 9 3.1. Plasmodium falciparum : ................................................................................................. 9 3.2. Plasmodium vivax : ......................................................................................................... 10 3.3. Paludisme ovale :............................................................................................................. 10 3.4. Paludisme malaria : ........................................................................................................ 10 3.5. Paludisme knowlesi :....................................................................................................... 10 4. VECTEUR : ........................................................................................................................ 115. CYCLE :.............................................................................................................................. 11 5.1. Chez l'homme : ................................................................................................................ 12 5.1.1. Schizogonie pré-érythrocytaire : ................................................................................ 12 5.1.2. Schizogonie érythrocytaire :....................................................................................... 13 5.2. Chez l'anophèle femelle : ................................................................................................ 14 5.3. Modalités de transmission :............................................................................................ 14 II. ANTIPALUDIQUE : ........................................................................................................ 15 1. CLASSIFICATION DES ANTIPALUDIQUES : ........................................................... 15 1.1. Les modes d’action des principaux antipaludiques actuels (2, 3) :............................. 15 1.1.1. Les schizon ticides électifs : ....................................................................................... 15 1.1.2. Les inhibiteurs des acides nucléiques :....................................................................... 15 1.1.3. Les nouvelles thérapeutiques antipaludiques : perspectives....................................... 16 III.LA PROTEINE FARNÉS YLTRANS FÉRASE : ......................................................... 19 1. LA STRUCTURE DE LA FTASE : ................................................................................. 19 2. LE MECANISME CATALYTIQUE DE LA FTASE : .................................................. 21 REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES :........................................................................... 25 CHAPITRE II : ETUDE QUANTITATIVE DES RELATIONS STRUCTURE-ACTIVITÉ (QSAR)......................................................................................................................................... II.1.INTRODUCTION : ........................................................................................................ 27 II.2.HISTORIQUE :............................................................................................................... 27 II.3.DEFINITION : ................................................................................................................ 28 II.4.PRINCIPE DE QSAR : .................................................................................................. 29 II.5.METHODOLOGIE GENERALE D’UNE ETUDE QSPR/QSAR : .......................... 30 II.5.1. Les bases de données :................................................................................................. 30 II.5.2. Les Descripteurs moléculaires : ................................................................................. 30II.6.METHODES D'ANALYSE DE DONNEES : .............................................................. 31 II.6.1. Analyse par composantes principales : ..................................................................... 31 II.6.2. La régression linéaire multiple : .............................................................................. 33 II.6.3. La régression non linéaire multiple :......................................................................... 34 II.6.4. La régression des moindres carrés partiels : ........................................................... 35 II.7. TEST DE LA SIGNIFICATION GLOBALE DE LA REGRESSION :................... 35 II.8. INTERPRETATION ET VALIDATION D’UN MODELE QSAR/QSPR : ............ 37 •Interne :.................................................................................................................................. 37 • Y-Randomisation :............................................................................................................... 38 • Externe :............................................................................................................................... 38 • Domaine d'applicabilité : .................................................................................................... 39 REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES :........................................................................... 41 CHAPITRE III APPLICATION ET RÉSULTAT ET DISCUSSION...................................... III.1.INTRODUCTION:........................................................................................................ 45 III.2.METHODOLOGIE : .................................................................................................... 45 III.2.1. Base de données : ....................................................................................................... 45 III.2.2. Calcul des descripteurs : ........................................................................................... 50 III.3. RESULTATS ET DISCUSSIONS : ............................................................................ 54 III.3.1. Analyse en composantes principales (ACP) :........................................................ 54 III.3.2. Répartition des données et développement de modèles : ....................................... 57 III.3.3. Analyse statistiques de meilleur Modèle MLR : ..................................................... 59 III.3.4.Régression non linéaire multiple (MNLR) :............................................................. 65 III.4.VALIDATION DU MEILLEUR MODELE QSAR : ................................................ 66 III.4.1.Validation interne :...................... 66 III.4.2. Validation externe : ................................................................................................... 67 III.4.3. Y-Randomisation de MLR et MNLR : .................................................................... 68 III.4.4. Domaine d’application :............................................................................................ 72 REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES :........................................................................... 76 CONCLUSION GENERAL :.................................................................................................. 78 |
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MCH/477 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Consultable |