| Titre : | Criblage virtuel dans la conception des médicaments appliqué dans une sériede composés anti-angiogenèses |
| Auteurs : | Aya Gaboussa, Auteur ; Soumia Kadri, Auteur ; Salah Belaidi, Directeur de thèse |
| Type de document : | Monographie imprimée |
| Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2020 |
| Format : | 1 vol. (88 p.) / couv. ill. en coul. / 30 cm |
| Langues: | Français |
| Résumé : |
Les facteurs de la croissance endothéliale vasculaire (VEGFs) sont des acteurs clés du développement des vaisseaux sanguins et lymphatiques.LeVEGFR-2 est le principal récepteur responsable de la signalisation neurogénique et vasculogène par le VEGFs,
impliquant la survie cellulaire, la migration et la mitogenesis. L'objectif de cette étude sur les 1.2.3-thiadiazole substitués,qui sont des inhibiteurs puissants de la kinase VEGFR-2 / KDR, est de discuter lesdifférentes méthodes de calcul et approches pour prédire la réactivité chimique etl'activité biologique, et établir un modèle de Pharmacophore pour de nouvellesmolécules bioactives. Les résultats tels que la longueur des liaisons, les charges dedistribution, les paramètres de Lipinski, règle de Veber, l’efficacitélipophile, les modèles Drug-likeness, sont signalés et discutés dans la présente étude. Aussi, un accord proche avec les résultats expérimentaux a été trouvé |
| Sommaire : |
LISTE DES ABREVIATIONS LISTE DES TABLAUX LISTE DES FIGURE Introduction générale……………………………………………………………………….......................1 Référence..............................................3 1erepartie : recherche bibliographique Chapitre I : Les 1, 2,3-thiadiazoles et ses dérivés dans le traitement des maladies. I.1. Introduction .....................................................................4 I.2 Inhibition de l’angiogenèse en thérapeutique..........................................................5 I.2.1 Qu’est ce que l’angiogenèse ..................................................................................5 I.2.2 Angiogenèse tumorale ..........................................................................................6 I.2.2.1 Découverte du lien angiogenèse/cancer..........................................................6 I.2.2 .2 Croissance tumorale et transition angiogéniques............................................6 I.2.2.3 Réseau vasculaire tumoral ...............................................................................8 I.2.2.4 Régulateurs de l’angiogenèse : facteurs pro et anti-angiogéniques.................9 I.2.3 Principaux acteurs de l’angiogenèse : Système VEGF/VEGFR...............................10 I.2.3.1 Le VEGF ..............................................................10 I.2.3.2 Signalisation cellulaire de vegfr-2...................................................................12 I.2.3.2.1 Structure du VEGFR-2.....................................................................12 I.2.3.2.2 fonction du VEGFR-2 ........................................................................12 I. 2.4. Inhibiteurs des tyrosine-kinases ...............................................................15 Références bibliographiques………………………...……………………………………..19 Chapitre II : Aperçu théorique sur les méthodes utilisées dans la modélisation moléculaire et les méthodes de sélection de candidats médicaments II.1.Introduction……………………………………………………………………………23 II.2 : Base de la chimie quantique.....................................................................23 II.3. Méthodes de calcul de la modélisation moléculaire....................................................25 II.3.1. Mécanique moléculaire...............................................................................26 II.3.1.1. Champ de force en mécanique moléculaire.......................................................27 II.3.1.1.1. Les différentes énergies.............................................................28 II.3.1.2.1.1Energie d’interaction entre atomes liés………………………..…….........29 a. Energie d’élongation…………………………………………………...…....29 b. Énergie de flexion angulaire (inflexion)……………………………..….......29 c. Énergie de torsion……………………………………………..…….............30 II.3.1.2.1.2. Energie d’interaction entre atomes non liés………………….…….........30 a. Energie d’interaction de Van der Waals (VDW)…………………................30 b. Energie d’interactions électrostatiques ……………………………..............31 c. Énergie de liaison hydrogène……………………………………….............31 II.3.2. Les méthodes semi-empiriques…………………………………………….........32. II.3.3 Méthodes de la mécanique quantique…………………………………………....33. II.3.4. Limitation de la modélisation moléculaire………………………………..……...35 II.3.5. Domaine d’application de la modélisation moléculaire………………………….35 II.4. Méthodes de la sélection des médicaments "screening virtuel and drug-likeness"...36 II.4.1 Le criblage virtuel ………………………………………………………….......37 II.4.2. Multi-Parameter Optimization (MPO) ...………………………………….......37 II.4.3. Méthodes de relations quantitatives structures activités/propriétés QSAR/QSPR.........................................................................................................................38 II.4.3.1 Principe des méthodes QSAR ……………………………………………...39 II.4.3.2 Les techniques de QSAR ………………………………………………......39 II.4.3.3 Les propriétés physico-chimiques de QSAR ……………………............... 40 a. La surface moléculaire (SAG)……………………………………............40 b.Le volume moléculaire (V)………………………………………….........40 c. La polarisabilité (Pol)………………………………………………........41 d. Energie d’hydratation ……………………………………………….......41 e. La réfractivité (MR) ………………………………………………….....41 f .Le coefficient de partage (logP)……………………………………….....42 g.L’énergie HOMO/LUMO …………………………………………......43 II.4.4. Les méthodes statistiques………………………………...........................43. II.4.4.1.Régression linéaire multiple (MLR)…………………………………......44 II.5. Quand pouvons-nous accepter le modèle QSAR développé comme fiabl prédictif......................................................................44 II.6. Programmes utilisées et matériels……………………………………….….........4 Références bibliographiques…………………………………………............................46 2èmepartie : Résultats et discussion Chapitre III : Étude structurale, Électronique et MESP sur le noyau de base : 1,2,3- thiadiazole , en utilisant plusieurs méthodes quantiques de calcul III.1 Introduction ………………………………………………………………….............51 III.2. Etude des propriétés structurales et électroniques de noyau de base de 1,2, 3- thiadiazole...........................................................................................................................52 III.3. Conclusion ………………………..…………………………...................................57 Références bibliographiques……………………………………………………….............................58 Chapitre IV : Étude qualitative de la relation structure-activité d'une série des dérivés de1, 2, 3-thiadiazole. IV.1. Introduction ……………………………………….…………...................................59 IV.2. Etude des propriétés QSAR de la série des dérivés de 1,2, 3-thiadiazole …….….....59 IV.2.2. Etude des paramètres amphiliques de la série 1,2, 3-thiadiazole …...................66 IV.3. QSAR Optimisation théorique et multi-paramètres (....70 IV.3.1 Représentation des Calculs « drug-like » sur la base de Lipinski ………….......70 IV.3.2. Les règles de Veber ……………………………………………………..........73 IV.3.3. Les règles de Ghose-Viswanadhan-Wendoloski ………………………….......75 IV.3.4. Efficacité de ligand « LE » …………………………………………………....78 IV.3.5. Efficacité lipophylique de ligand (LLE) ……………………………………...80 IV.4. Conclusion …………………………………………………………….....................83 Références bibliographiques …………………………………………………………....... 85 Conclusion générale …………………………………………………………………….....87 Annexes |
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| Cote | Support | Localisation | Statut |
|---|---|---|---|
| MCH/471 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Consultable |
