| Titre : | Etude de la relation structure-activité des dérivés bioactives d’un hétérocycle (2-pyridyle pyrimidine) |
| Auteurs : | Ilham Hammadi, Auteur ; Nacira Hazazi, Auteur ; Sihem Aggoun, Directeur de thèse |
| Type de document : | Monographie imprimée |
| Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2020 |
| Format : | 1 vol. (86 p.) / couv. ill. en coul / 30 cm |
| Langues: | Français |
| Mots-clés: | QSAR,pyrimidine,modélisation moléculaire,DFT,HF,activité biologique |
| Résumé : |
Dans ce travail, une recherche fondamentale et originale sur l‘hétérocycle 2pyridyl pyrimidine est réaliséen dans le but est de prédire de la réactivité et de l'activité biologique du composé étudié et ses dérivés. Les méthodes de modélisation moléculaire utilisées dans notre travail sont : HF(6-31G ; 6-31G+ (d,p) ; 6- 311G++(d,p)) DFT(B3LYP)(6-31G ; 6-31G+ (d,p) ; 6-311G++(d,p)). Ces méthodes ont été utilisées pour déterminer les paramètres structuraux, électroniques et énergétiques associés aux molécules étudiées. La nature de type de substituant influe sur les paramètres électroniques et énergétiques de noyau de base 2pyridyl pyrimidine. En effet, cette étude nous permet de prédire la réactivité chimique des dérivés de noyau de base . Une étude qualitative de la relation structure -activité a été effectuée également pour une séries de 30 molécules bioactives de dérivés des 2-pyridyl pyrimidine. Les molécules utilisées dans cette étude possèdent des activités pharmacologiques. |
| Sommaire : |
Liste de tableau Liste des figures Liste des principales abréviation Introduction générale………………………………………..………………………..…….01 Référence…………………………………………………...…………………………....…..04 Chapitre I :Généralité sur la réactivité de la molécule 2-pyridyl pyrimidine I.1. Introduction ………………………………………………….……………………...…....07 I.2. Généralités sur les hétérocycles…………………………………………………………08 I.2.1. Classification et nomenclature…………………………………………………………..08 I.3. la chimie de 2-pyridyl pyrimidine…………………………………………………….....09 I.4. les méthodes générales de synthèse de 2-pyridyl pyrimidine…………….…………….10 I.5. Les propriétés chimique de 2-pyridyl pyrimidine……………………….……………..13 I.6. les applications pharmaceutiques de 2-pyridyl pyrimidine………………….…………14 I.7. activités biologiques de pyrimidines……………………………………..……………….15 I.7.1. Activité anticancéreuse…….……………………………………………..………………15 I.7.2. Activité antivirale………………………………………………………………..………..15 I.7.3.Activité antibactérienne…………………………………………………………..……….16 I.7.4.Activité antibiotique…………………………………………………………….…………16 I.7.5.Activité anti-inflammatoire et activité analgésique………………………………………..16 I.7.6.Activité antifongique…………..……………………………………….………………….16 I.7.7.Activité antiparasitaire…………………………………………………..…………………16 I.7.8. Activité anti-hypertensive…………………………………………….…………...………17 I.7.9 Activité antituberculeuse…………………………………………………………………...17 Références bubliographique…………………………………………………………………18 Chapitre II : Etude quantitative des relations structure /activité QSAR I. Introduction…………………………………………………………………………………21 II.1- L'activité biologique……………………………………………………………………..21 II.1.1- Les différentes cibles/récepteurs des médicaments……………………………………21 II.1.1.1 Récepteurs couplés à des protéines G ..........................................................................22 II.1.1.2 Récepteurs-enzymes……………………..…………………………………………...22 II.1.1.3 Récepteurs canaux……………………………………………………………………22 II.1.1.4 Récepteurs de structures diverses……...………………………………………...……23 II.1.2 Etude de la liaison ligand –récepteur……………………………………………………23 II.1.2.1 La liaison chimique mettant en jeu des électrons………………………………….….23. a. La liaison covalente (homopolaire)………………………………………………...23 b. La liaison ionique (hétéropolaire)……………………………………………….…23. c. La liaison métallique....................................................................................................23 II.1.2.2 La liaison chimique ne mettant pas en jeu des électrons……………………………23 II.1.3- Les paramètres biologiques…………………………………………………………….25 II.2- QSAR………………………………………………………………………………...…25 II.2.1 –Introduction…………………………………………………………………………….25 II.2.2- Représentation des méthodes de calcul............................................................................26 II.2.2.1- Méthodes empiriques (non quantiques )………………………………………….…..26 II.2.2.1.1- Hückel simple et étendue...........................................................................................26 II.2.2.1.2- Mécanique moléculaire……………………………………………………………..27 a. Fonction d‘énergie potentielle…………………………………………….……27 b. Terme des atomes liées…………………………………………………………28 c. Terme des atomes non liée……………………………………………...………28 d. Terme du champ de force………………………………………………………29 e. Différents champs de force en mécanique moléculaire……………......………...29 f. Minimisation de l‘énergie stérique………………………………………..……30 II.2.2.1.3- Dynamique Moléculaire…………………………………………………….……30 a. Principe de la dynamique moléculaire……………………………….……..30 b. Calcul de dynamique moléculaire………………………………………….31 II.2.2.2 – Méthode quantique………...……………………………………………………33 II.2.2.2.1 Equation de Schrödinger ………………………………………………………….33 II.2.2.2.2 L'approximation de Born-Oppenheimer…………………………………………...34 II.2.2.2.3 La théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT)………………………………...35 II.2.2.2.4 Les bases d‘orbitales ……………………………………………………………....35 II.2.2.2.5 Méthodes ab-initio ( Hartree-fock, Roothan)……………………………..………..36 II.2.2.3 -QSAR (relation quantitative structure –activité)……….………………....……….37 II 2.2.3.1-volume et surface moléculaire…………………………………………….………38 II 2.2.3.2-l‘énergie d‘hydratation................................................................................................38 II.2.3 – Les paramètre utilisés dans l‘étude QSAR……….…………………………..……39 II.2.3.1- les paramètres électroniques…………………………..…………………...………..39 a- la polarisabilité………………….………………………………………..…….39 II.2.3.2- les paramètres d‘hydrophobicité….……………………………………………..…39 a. Les Interactions hydrophobes………………………….………………..….40 b. Coefficient de partition (P)…………………………….……………..…….40 II.2.3.3- les paramètres stériques……………………………………….……………..…….42 a- Réfractivité molaire….………………………………….…………….…….42 II.2.4 – les applications de l‘étude QSAR……….……………………………………….43 Références bubliographique…………………………..…………………………………..…..45 Chapitre III : Résultat et discussion III.1. Introduction………………………………………….…………………………………..50 III.2. Etude des propriétés structurales et électroniques du noyau de base………………..51 ط Interprétation…………………...………………………………………………………...59 III.3. Etude de l’effet de la substitution sur le squelette de base de 2-pyridyl pyrimidine……………………………………………………………………………………….61 III.4. Etude des propriétés QSAR d’une série des trente molécules bioactives de dérivés de 2-pyridyl pyrimidine ………………………………………………………………………….70 III.4.1. Sélection d‘une série bioactives de 2-pyridyle pyrimidine……...………….……………71 III.4.2. Résultats et discussions…………..………….………………………………………….82 III.5.Logiciels utilisés….………….…………………………………………………………….83 Références bibliographiques……………………………………………………………………84 Conclusion générale ……………………………………………………………………………86 |
Disponibilité (1)
| Cote | Support | Localisation | Statut |
|---|---|---|---|
| MCH/458 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Consultable |
