| Titre : | Etude par modélisation moléculaire de la migration sigmatropique de la liaison d’hydrogène dans des dérivés de l’ADN. |
| Auteurs : | Souria Souici, Auteur ; Samah Bourezg, Auteur ; Oumhani Youcef, Directeur de thèse |
| Type de document : | Monographie imprimée |
| Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2020 |
| Format : | 1 vol. (70 p.) / couv. ill. en coul. / 30 cm |
| Langues: | Français |
| Sommaire : |
LISTE DES TABLEAUX LISTE DES FIGURES LISTE DES PRINCIPALES ABREVIATIONS INTRODUCTION GENERALE........................................................1 REFERENCES......................................................................................3 CHAPITRE I : Partie A : Les propriétés physicochimiques et la réactivité chimique de l’ADN I .1Introduction......................................................................................4 I.2. Structure de l’ADN.................................................................................5 I.2.1. Structure primaire...................................................................5 I.2.1.1.cytosine................................................................................6 I.2.1.2.cytidine.........................................................................................7 I.2.2. Structure secondaire...................................................................9 I.2.3. Structures des bases complémentaires........................................................................10 I.3. l'ADN aux protéines..............................................................................10 I.3.1.Transcription.........................................................................................11 I.3.2.Traduction.........................................................................11 I.4.Les agressions sur les acides nucléiques et les dommages générés..............................13 I.4.1.Généralités....................................................................13 I.4.2.Les hydrolyses.......................................................13 I.4.3.Les alkylations........................................................14 I.4.4.Les oxydations..................................................................15 I.5. Les effets biologiques du rayonnement UV...................................................16 I.6. Exemples sur les maladies de la peau causée par les rayons UV.......................................16 I.6.1. Les cancers de la peau.............................................................................16 I.6.2. Xeroderma pigmentosum (XP)...............................................................17 REFERENCE...............................................................................18 Partie B : la migration sigmatropique I.7.Les réarrangements (migrations) sigmatropiques................................................................21 I.7.1. Généralité...................................................................................................21 I.7.2. Définitions................................................................................................21 I.7.3. Réarrangements [1,j].................................................................................22 I.7.3.1. Réarrangements [1,3] (4 électrons).....................................................................22 I.7.3.2. Réarrangements [1,5] (6 électrons)...................................................................23 I.7.3.3. Réarrangements [1,7] (8 électrons)...................................................................23 I.7.4. Rearrangements [i,j].....................................................................24 I.7.4.1. Réarrangements sigmatropiques [2,3]..........................................................25 I.7.4.2. Réarrangements sigmatropiques [3,3]..........................................................25 I.7.4.2.1. le réarrangement de Cope.....................................................................26 I.7.4.2.2.le réarrangement de Claisen...................................................................26 REFERENCES.............................................................................................27 CHAPITRE II: la modélisation moléculaire II.1.Introduction..................................................................................................28 II.2. les méthodes de la modélisation moléculaire...............................................................28 II.2.1. Méthodes quantiques............................................................................29 II. 2.1.1.L’approximation de Born-Oppenheimer...........................................................30 II. 2.1.2.Méthodes ab-initio (Hartree- Fock- Roothann)........................................30 II. 2.1.3.Types de base...............................................................31 II. 2.1.4. La théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT)..........................................32 II. 2.1.5.méthodes semi-empiriques.........................................................33 II. 2.2.La dynamique moléculaire.....................................................34 II. 2.3.La mécanique moléculaire........................................................................34 II. 2.3.1.Énergie d’interaction entre atomes liés.............................................................35 II. 2.3.1.1.Elongation des liaisons: (stretching).............................................35 II. 2.3.1.2.déformation des angles de valences: (bending)........................................36 II. 2.3.1.3. Energie de torsion........................................................................36 II. 2.3.2.Energie d’interaction entre atomes non liés......................................................37 II. 2.3.2.1.Interaction de Van der Waals....................................................................37 II. 2.3.2.2.Interactions électrostatique.......................................................................38 II. 2.3.2.3.Energie de liaison hydrogène....................................................................39 II. 2.3.3.Champ de force.............................................................39 II. 2.3.3.1.Quelques champs de force.........................................................................40 II. 2.3.4.Minimisation d'énergie.............................................41 II. 3.Méthodes La Relation Quantitative Structure et Activité (QSAR)..................................41 REFERENCES.........................................................42 CHAPITRE III: étude théorique par modélisation moléculaire de la migration sigmatropique de l’hydrogène dans la formation de tautomères de cytosine et cytidine III.1.Introduction........................................................................45 III.2.Méthode de calcul.............................................................46 III.3. Résultats et discussion..................................46 III.3.1. la Structure géométrique et électronique de cytosine et cytidine.............................46 III.3.2. la migration sigmatropique [1.3] d’hydrogène dans la molécule cytosine..............48 III.3.3. Etude des propriétés structurales et électroniques de cytosine................................49 III.3.4. la migration sigmatropique [1.3] d’hydrogène dans la molécule cytidine..............52 III.3.5. Etude des propriétés structurales et électroniques de cytidine................................55 III.3.6. La géométrie moléculaire de cytidine.................................................58 III.3.7. Surface de potentiel électrostatique moléculaire (MEPS)..........................62 III.4. Conclusion..............................................................63 REFERENCES.................................................................65 Conclusion général................................................................ |
Disponibilité (1)
| Cote | Support | Localisation | Statut |
|---|---|---|---|
| MCH/456 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Consultable |
