| Titre : | Etude qualitative et quantitative des relations structure-activité d’une série de composés phénoliques |
| Auteurs : | Souhila Belouerghi, Auteur ; Souad Azri, Auteur ; Faiza Lehraki, Directeur de thèse |
| Type de document : | Mémoire magistere |
| Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2020 |
| Format : | 1 vol. (76 p.) / couv. ill. en coul. / 30 cm |
| Langues: | Français |
| Mots-clés: | Activité antioxydante,Composés phénolique,Radical libre,SAR,QSAR,MLR. |
| Résumé : |
Ces dernières années, l’intérêt porté aux antioxydants, en relation avec leurs propriétés thérapeutiques, pharmacologiques… a augmenté considérablement. Une étude qualitative de la relation structure–/activité (SAR) a été effectuée pour une série de dérivés du phénol. La nature des groupements sur le noyau hétérocyclique des molécules étudiées affecte leurs propriétés physicochimiques et par conséquence sur leurs propriétés pharmacologiques. Une étude QSAR a été effectuée sur 25 dérivées de phénol. La régression linéaire multiple (MLR) a été utilisée pour quantifier la relation entre les descripteurs moléculaires et l’activité antioxydante des composés phénolique. Le pouvoir prédictif du modèle obtenu a été confirmé par R = 0,955, R² = 0,911, S = 0,066 et F = 51,359. La méthode de validation croisée LOO nous montre une forte corrélation qui a été observée entre les valeurs expérimentales et prédites des activités biologiques, ce qui indique la validité et la qualité des modèles QSAR obtenus. |
| Sommaire : |
Liste des figures Liste des tableaux Liste des abréviations Introduction générale………………………………………………………………………..1 Références bibliographiques………………………………………………………….……..3 I.1. Introduction ....................................................................................................................... 4 I.2. Composés phénoliques ...................................................................................................... 5 I.2.1. Classification des polyphénoles: ....................................................................................... 5 I.2.1.1. Les phénols simples et acides phénoliques: ......................................................... 5 I.2.1.2. Les flavonoïdes: ..................................................................................................... 7 I.2.1.3. Les tannins: ........................................................................................................... 8 I.2.1.4. Les coumarines: .................................................................................................... 9 I.2.1.5. Les quinones:....................................................................................................... 10 I.2.2. Propriétés biologiques des polyphénols ....................................................................... 10 I.3. Radicaux libres et Stress oxydatif .................................................................................... 11 I.3.1. Radicaux libres .................................................................................................................. 11 I.3.1.1. Définition ............................................................................................................ 11 I.3.2. stress oxydant .................................................................................................................... 11 I.3.2.1. Définition ............................................................................................................ 11 I. 3.2.2. Les maladies liées au stress oxydant ................................................................. 12 I.3.3. Différents types des radicaux libres .............................................................................. 12 I.3.4. Origine de production des radicaux libre .................................................................... 13 I.3.5. Dommages causés par les radicaux libres ..................................................................... 13 I.3.5.1. Action sur l’ADN ............................................................................................... 14 I.3.5.2. Action sur les lipides ......................................................................................... 14 I.3.5.3. Action sur les glucides ....................................................................................... 14 I.3.5.4. Action sur les protéines…………………………………………………..…...14 I.3.6. Systèmes de défense contre les ERO ............................................................................ 15 I.4. Les anti oxydants .............................................................................................................. 15 I.4.1. Antioxydants enzymatiques ........................................................................................... 15 I.4.2. Antioxydants non enzymatiques ................................................................................... 16 I.4.3. Modes d’action anti-oxydante des phénols ................................................................. 17 I.4.3.1. Piégeage direct des radicaux libres : .................................................................. 17 I.4.3.2. Chélation des ions métalliques : ....................................................................... 17 I.4.3.3. L’inhibition des enzymes responsables de la génération des ERO: ................. 17 I.4.4. Méthodes de quantification de l’activité anti-oxydante .......................................... 18 Sommaire Chapitre I: Généralités sur les composés phénoliques et l’activité antioxydante Références bibliographiques……………………………………………………………….20 II.1. Introduction………………………………………………………………………........24 II.2.Méthodes de calcules…………………………………………………………………...25 II.2.1.Méthodes quantiques……………………………………………………………...25 II.2.1.1. Méthodes semi empiriques...……………………………………………….25 II.2.1.2. Méthodes ab initio………………………………………………………..…25 II.2.1.3. La théorie de la fonctionnelle de la densité DFT…………….……………26 a. L’objectif…………………………………………………………………………...26 b. Approximations en DFT…………………………………………………………..27 b.1. Approximation locale de la densité (LDA)………………………………….....27 b.2. L’approximation du gradient généralisé (GGA)………………………………..27 b.3. Fonctionnelles hybrides pour le calcul moléculaire……………………………28 c. La fonctionnelle B3LYP…………………………………………………………….28 d. Bases d’orbitales atomiques………………………………………………………...28 II.2.2. Mécanique moléculaire…………………………………………………………...30 II.2.2.1. Différents champs de force en mécanique moléculaire……………………31 II.2.2.2.Principes de la minimisation…………………………………………………33 II.2.3. Dynamique moléculaire…………………………………………………………..33 II.3. QSAR…………………………………………………………………………………....34 II.3.1. Principe de QSAR…………………………………………………………………34 II.3.2. Les applications de l’étude QSAR…………………………………………………35 II.3.3. Outils et Méthodologie de QSAR………………………………………………...35 II.3.3.1. Paramètres biologiques……………………………………………………...35 II.3.3.2. Utilisation des descripteurs moléculaires…………………………………...36 II.3.3.3. Sélection et réduction du nombre de descripteurs…………………………40 II.4. Méthodes statistiques…………………………………………………………………..41 II.4.1. Définition………………………………………………………………………….41 II.4.2. Méthodes statistiques……………………………………………………………..41 II.4.2.1. La statistique descriptive…………………………………………………….42 II.4.2.2. La statistique décisionnelle ou prédictive………………………………..…42 II.4.3. La régression linéaire multiple…………………………………………………..43 II.4.4. Techniques de validation…………………………………………………………44 II.4.4.1. Coefficients et tests statistiques standards…………………………………..44 a. Coefficient de corrélation r (et coefficient de détermination r²)…………………44 Chapitre II : Bases théoriques b. Le coefficient de détermination ajusté r²adj………………………………………45 c. L’erreur type résiduel « s » (La déviation standard)…………………..…………..45 d. Le test de Fisher F………………………………………………………..………...46 II.4.4.2. Pouvoir de prévision………………………………………………………...47 a. Interne………………………………………………………………………….…..47 b. Externe………………………………………………………………………………48 Références bibliographiques………………………………………………………………..50 III.1. Introduction…………………………………………………………………………...54 III.2. Présentation de la série de molécule, Méthodes et Matériel………………………..54. III.2.1. Série de molécule………………………………………………………………..54 III.2.2. Méthodes et matériels…………………………………………………………...54 III.3. Etude qualitative des relations structure/activité (SAR) dans les dérivés du phénol…………………………………………………………………..56 III.4. Les méthodes d’optimisation multiparamètres (MPO) ………………………........59 III.4.1. Règle de lipinski………………………………………………………………....59 III.4.2. Règle de Veber……………………………………………………………………61 III.4.3. Triangle d'or (Golden triangle)………………………………………………….63 III.5. Étude quantitative de la relation structure-activité d’une série de dérivés de phénol ……………………………………………………………65 III.5.1. Descripteurs………………………………………………………………………65 III.5.2. Corrélation entre différent descripteurs………………………………………...67 III.5.3. Equation du modèle QSAR………………………………………………………68 III.5.4. Validation de modèle…………………………………………………………….70 Références bibliographiques………………………………………………………………..74 Conclusion générale…………………………………………………………………………77 |
| Type de document : | Mémoire master |
Disponibilité (1)
| Cote | Support | Localisation | Statut |
|---|---|---|---|
| MCH/444 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Consultable |
