| Titre : | Étude QSAR par modélisation moléculaire d'une série bio-active(thiazolinone) |
| Auteurs : | Boulahia Selma, Auteur ; Malika Mellaoui, Directeur de thèse |
| Type de document : | Monographie imprimée |
| Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2019 |
| Format : | 1 vol. (89 p.): couv. ill. en coul / 269Cm |
| Langues: | Français |
| Mots-clés: | DFT,modélisation moléculaire,structure-activité,QSAR |
| Résumé : |
La modélisation de propriétés et d’activités biologiques de molécules constitue un champ de recherche important, qui permet par exemple de guider la synthèse des médicaments et l’étude de leurs réactivités chimiques. Dans le cadre de ces travaux de recherche, nous sommes intéressés à l’étude de la relation structure-activité des dérivés THIAZOLINONE par des différentes méthodes de modélisation moléculaire. On a réalisé une comparaison structurale et électronique avec des différentes méthodes théoriques (Ab-initio, DFT) et on a trouvé une similitude entre les résultats obtenus par les deux méthodes. Par la comparaison entre les résultats .on remarque que la méthode de DFT est plus proche et la plus approprié pour faire des calculs sur le noyau tTHIAZOLINONE la méthode de DFT permet d’étudier les propriétés structurales et l’effet de substitution L’étude de l’effet de la substitution sur notre noyau par les groupements donneurs : méthyle, éthyle , les groupements accepteurs : cyanure, chlorure se présente comme suit : les plus actives chimiquement sont : le composé que les plus actives chimiquement groupement électro attracteur (A6 ,A3)et des groupes électro donneurs (B1 ,B2) Les études QSAR trouvé une relation entre les propriétés physicochimiques telles que l’énergie d’hydratation, la lipophile, le volume moléculaire …etc. |
| Sommaire : |
LISTE DES TABLEAUX LISTE DES FIGURES LISTE DES PRINCIPALES ABREVIATIONS INTRODUCTION GENERALE …………………………………………………………..1 REFERENCES ……………………………………………………………………………….3 CHAPITRE I : Généralité sur la réactivité de Thiazolinone I .LE CANCER ………………………………….………………………………………………5 I.1. 2. Progression tumorale et immortalité ………………….…………..………………….….5 1.2. 1 - Fiche signalétique de la cellule cancéreuse ………………...………….………..6 1.2. 2. Membrane…………………………………………………………………....…….7 1.2. 2.1 Aspects morphologiques……………………..……….……………...………7 . 1.2.2.2 Aspects fonctionnels…………………………..……………...…………………..7 I.2. GENERALITES SUR LES HETEROCYCLES ………….………………….…………...8 I.2.1. CLASSIFICATION………………………………….…………………..……………..8 I.3. LA STRUCTURE DE THIAZOLINONE………………….………….…………………9 I.3. 1Synthèse THIAZOLINONE…………………………….……………….….………….9 1. 3. 1.1 A partir du compose cyanoacétamides ………………….………………………………9 1.3.1.2. A partir du compose PYRAZOLY THAZOLINONE…….….……………..10 I.3.2 Activités biologiques des dérivés de THAZOLINONE………………………………10 REFERENCES…………………………………………………………………………………..12 CHAPITRE II: Représentation des méthodes de calculs II.1. Introduction……………..…………………………………………….…………….…..…14 II.2. La modélisation moléculaire …………………………………………….………….……14 II.2.1 Objectifs de la modélisation moléculaire……………………………………………..15 II.2.2. Domaine d’application de la modélisation moléculaire………………………….…..16 II.3. La mécanique quantique (MQ)……………………………… ………………………….17 II.4. La base de la chimie quantique…………………………………………………………..18 II.4.1. L’équation de Schrödinger …………………………………….…………………………18 II.4.1.1. L'approximation de Born-Oppenheimer………………………………………………..20 II.4.1.2. L’approximation Orbitalaire……………………………………...……………..22 II.4.1.3. L'approximation LCAO ………………………………………..………………………23 II.5. Représentation des méthodes de calculs…………………………………………………24 II.5.1. Mécanique moléculaire………………………………………………….....…………….24 II.5.1.1. Champ de force en mécanique moléculaire ………………………………………..25 II.5.1.2. Modèle d’énergie……………………………………….……………………27 II.5.1.2.1. Energie d’interaction des atomes liés……………………….……………...28 II.5.1.2.1.1. Energie d’élongation……………………………………………………..28 II.5.1.2.1.2. Energie de déformation des angles de valence…………………………...29 II.5.1.2.1.3. Energie de torsion………………………………………………………...29 II.5.1.2.2. Energie d’interaction des atomes non-liés ………………………………………….30 II.5.1.2.2.1. Energie de van der Waals………………………………………………………….30 II.5.1.2.2.2. Energie des interactions électrostatiques………………………………………….31 II.5.1.2.2.3. Energie de liaison hydrogène………………………………………………………32 II.5.1.2.2.4. Adjonction de termes croisés……………………………………………………….32 II.5.2. Méthodes La Relation Quantitative Structure et Activité (QSAR)……………………...33 II.5.3. Dynamique Moléculaire (DM)…………………………….……………………………34 II.5.3.1. Le principe de la Dynamique Moléculaire (DM)…………………...…………..34 II.5.4. Méthode semi-empirique…………………………………………………...…….………35 II.5.5. Méthodes ab-initio (Hartree-fock-roothann) ……………………………………………..37 II.5.5.1. Signification de quelques bases gaussiennes…………………………………………...38 II.5.6. La Théorie de la Fonctionnelle de la Densité (DFT)……………………………………..38 II.6. Programmes et matériels utilisés…………………………………………………………40 REFERENCES…………………………………………..………………………………………41 CHAPITRE III:Etude de la géométrie et des propriétés électroniques du noyau de base: Thiazolinone et ses dérivés III.1. Introduction……………………………………………………………………………...46 III.1.1. Effets de substituant sur les orbitales frontières………………….………………….47 III.1.1.1. L’effet des substituant donneurs………………………………….…………………..48 III.1.1.2. L’effet des substituant accepteurs………………………………….………………..48 III.1.2. surface de potentiel électrostatique moléculaire (MEPS)………… ……………….49 III.2. Etude des propriétés structurales et électroniques du noyau de base……………….49 III.3. Etude de l’effet de la substitution sur le squelette de base deTHIAZOLINONE……56 III.3.1. Effet d’un substituant électroattracteur de THIAZOLINONE..…………………………57 III.3.2. Effet d’un substituant électrodonneur de THIAZOLINONE….…………………59 REFERENCES…………………………………………………………………………………..64 CHAPITRE IV :Etude de la relation structure-propriétés d’une série des molécules bioactives des dérivés de Thiazolinone IV.1. Introduction…………………………………………………………………….66 IV.2. Les propriétés QSAR qui caractérisant la structure moléculaire…………………….66 IV.2.1. Volume et surface moléculaire…………………………………………………………66 IV.2.2. Polarisabilité et réfractivité molaire……………………………………………………68 IV.2.3. Energie d’hydratation…………………………………………………………………..69 IV.2.4. Coefficient de partition (Log P)………………………………………………….…70 IV.3. Les propriétés « drug-like »………………… …………………………………………73 IV.4. Etude des propriétés QSAR d’une série des vingt molécules bioactives des dérivés de THIAZOLINONE……………………………………………………….................................74 IV.4.1. Sélection d’une série bioactives de THIAZOLINONE………………………………...74 IV.4.2. Résultats et discussions………………………………………………………………..78 IV.5. Application de la règle de cinq ou règle de Lipinski………………………………….85 IV.6. Conclusion ………………………………………………………………………………86 REFERENCES…………………………………………………………………………………88 CONCLUSION GENERALE………………………………………………………………..89 |
Disponibilité (1)
| Cote | Support | Localisation | Statut |
|---|---|---|---|
| MCH/414 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Consultable |
