| Titre : | Application de la méthode DFT dans l’étude quantitative des relations structure-activité d’un ensemble de composés à visées thérapeutique |
| Auteurs : | Amira Zergui, Auteur ; Afaf Zekri, Directeur de thèse |
| Type de document : | Monographie imprimée |
| Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2019 |
| Format : | 1 vol. (82 p.): couv. ill. en coul / 29 cm |
| Langues: | Français |
| Mots-clés: | (E) N-Aryl-2-sulfonamide,DFT,LOO,QSAR,MLR |
| Résumé : |
Une étude QSAR a été effectuée sur vingt quatre(24) molécules analogues de la régression multilinéaire (MLR) a été utilisée pour quantifier les dérives (E) NAryl-2-ethene sulfonamide relations entre les descripteurs moléculaires et les propriétés de chimioprévention des dérives (E) N-Aryl-2-ethene sulfonamide. Les descripteurs utilisés ont été calculés par la méthode DFT en utilisant la base 6.31G. Le pouvoir prédictif de modèle obtenus a été confirmé par la méthode de Validation -Croisée (LOO). Une forte corrélation a été observée entre les valeurs expérimentales et prédites pour l’activité biologique anticancéreuse de prostate. |
| Sommaire : |
Liste des tableaux Liste des figures Liste des abréviations Introduction générale……………………………………………………………………….….1 Références biographiques…………………………………..………………………………….3 Chapitre I : Généralités sur la maladie du cancer de prostate et les sulfonamides. I.1.1.Introduction……………………………………………………………………………….4 I.1.2. Le cancer de la prostate………………………………………………………………….4 I.1.3.Les traitements……………………………………………………………………………5 I.1.3.1.La radiothérapie externe………………………………………..………………………5 I.1.3.2.La curiethérapie………………………………………………………………………...6 I.1.3.3.La chimiothérapie………………………………………………………………………6 I.1.3.4.Les ultrasons focalisés de haute intensité………………………………………………6 I.1.3.5.L’hormonothérapie……………………………………………………………………..6 I.2.L’historique de sulfonamide………………………………………………………………..7 I.2.1.Sulfonamide ……………………………………………………………………………...7 I.2.2.Mécanisme d’action …………………………………………………………………...…8 I.3.Activité thérapeutique des sulfonamides…………………………………………………...9 I.3.1.Sulfonamides à usage local ………………………………………………………….….10 a) Effet local digestif……………………………………………………….…………10 b) Effet local cutané…………………………………………………………………...10 I.3.2.Sulfonamides à usage systémique………………………………………………………11 a) Sulfonamides à usage ORL...............................................................................….....11 b) Les sulfamides urinaires...................................................................................….....11 I.4.Propriétés chimiques des sulfamides…………………………………………………...…12 I.4.1.Caractères organoleptiques……………………………………………………………...12 I.4.2.Point de fusion…………………………………………………………………………..12 I.4.3.Solubilité…………………………………………………………………………...……13 Références bibliographiques…………………………………………………………….14 Chapitre II: Généralités sur la modélisation moléculaire. II.1.1.Introduction ……………………………………………………………………………17 II.1.2.Mécanique quantique…………………………………………………………………..17 II.1.3. Base de la chimie quantique…………………………………………………………...18 II.1.4. Les méthodes ab –initio……………………………………………………………….19 II.1.5. La méthode semi-empirique…………………………………………………………...19 II.1.6. Méthode Hartree –Fock……………………………………………………………….19 II.1.7.La méthode de théorique densité fonctionnelle……………………………………….20 II.1.7.1.Théorèmes de Hohenberg et Kohn…………………………………………………..20 II.1.7.1.1 Le 1er théorème…………………………………………………………………….21 II.1.7.1.2. Le 2eme théorème……….………………………………………………………...21 II.1.7.2.L’approximation de la densité Locale (LDA)….…………………………………….21 II.1.7.3.Approximation de Gradient généralisé……………………………………………….22 II.1.8. Base et fonctionnelle utilisée…………………………………………………………..22 II.1.8.1.La fonctionnelle B3LYP …………………………………………………………….22 II.1.8.2. La base 6-31G……………………………………………………………………….22 II.1.9. Mécanique moléculaire………………………………………………………………..22 II.1.9.1.Le champ de force……………………………………………………………………23 II.1.9.2.Energie d’interaction entre atomes liés……………………………………………....23 II.1.9.2.1.Energie d’élongation……………………………………………………………….24 II.1.9.2.2.Energie de torsion …………………………………………………………………24 II.1.9.2.3.Energie de rotation (flexion)……………………………………………………….25 II.1.9.3.Energie d’interaction des atomes non-liés…………………………………………....25 II.1.9.3.1.Energie de van der Waals ………………………………………………………….25 II.1.9.3.2. Interactions électrostatiques……………………………………………………….26 II.1.9.3.3.Energie de liaisons hydrogène……………………………………………………...26 II.1.9.4. Dynamique moléculaire……………………………………………………………..27 II.2.Généralité sur la chimiometrie…………………………………………………………...27 II.2.1.La régression multiple linéaire RML ………………………………………………….28 II.2.2.Test de la signification globale de la régression………………………………………..28 II.2.2.1.coefficient de corrélation (R(…………………………………………………………28 II.2.2.2.Coefficient de détermination R² ……………………………………………………..28 II.2.2.3.Le coefficient de détermination ajusté r² adj…………………………………………29 II.2.2.4.Déviation standard (SD)……………………………………………………………...29 II.2.2.5.coefficient de corrélation de validation croisée RCV 2 ………………………………...29 II.2.2.6.Le test de Student …………………………………………………………………....29 II.2.2.7.Test Fischer-Snedecor (F)…………………………………………………………....30 II.2.2.8.L’analyse de la variance …………………………………………………………......31 II.2.2.9.Coefficient de prédiction…………………………………………………………......31 II.2.2.10.Validation des modèles ………………………………………………………….....31 Références bibliographiques……………………………………………………………….33 Chapitre III : Etude quantitative de la relation structure/activité biologique. III.1.1.Introduction……………………………………………………………………………36 III.1.2. Principe de QSAR ……………………………………………………………………36 III.1.3. Paramètres biologiques……………………………………………………………….37 III.1.4.Les descripteurs QSAR………………………………………………………………..37 III.1.5.Les descripteurs physico-chimiques ………………………………………………….38 III.1.6.Les descripteurs électroniques………………………………………………………...38 III.1.7.Les descripteurs topologiques…………………………………………………………38 III.1.8.Les applications de l’étude QSAR…………………………………………………….38 III.1.9. Paramètres caractérisant structure moléculaire……………………………………….39 III.1.9.1.Le poids moléculaire………………………………………………………………. 39 III.1.9.2.La densité……………………………………………………………………………39 III.1.9.3.Le volume moléculaire……………………………………………………………...39 III.1.9.4.L’indice de réfraction……………………………………………………………….40 III.1.9.5.Le parachor …………………………………………………………………………40 III.1.9.6.La surface de tension………………………………………………………………..40 III.1.9.7.Le nombre de donneurs de liaisons hydrogène……………………………………..40 III.1.9.8.Le nombre d'accepteurs de liaisons hydrogène ……………………………………..40 III.1.9.9.L’énergie totale……………………………………………………………………...41 III.1.9.10.Le moment dipolaire……………………………………………………………….41 III.1.9.11.Les énergies des orbitales frontières…………………………………………….....41 a) L’énergie HOMO……………………………………………………………………...41 b) L’énergie LUMO……………………………………………………………………...41 III.1.9.12.Polarisabilité………………………………………………………………………..42 III.1.9.13.Réfractivité molaire (MR)…………………………………………………………42 III.1.9.14.Coefficient de partition (Log P) …………………………………………………...42 III.2. Résultats et discussions…………………………………………………………………43 III.2.1.Données expérimentales………………………………………………………………43 III.2.2.Méthodes des calculs utilisées………………………………………………………..47 III.2.3.Développement des modèles QSAR ………………………………………………….49 III.2.4.Validation des modèles QSAR………………………………………………………..50 III.3.Etude des propriétés physico-chimiques, des paramètres de lipinski, de veber…………54 III.3.1.Les règles de lipinski…………………………………………………………………..54 III.3.2.Les règles de Veber …………………………………………………………………...55 III.4.Logiciels utilisés………………………………………………………………………...57 Références biographiques…………………………………………………………………….58 Conclusion générale…………………………………………………………………………..61 Annexe. |
Disponibilité (1)
| Cote | Support | Localisation | Statut |
|---|---|---|---|
| MCH/399 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Consultable |
