| Titre : | Etude de la structure et des propriétés physico-chimiques associées, de quelques molécules bioactives à intérêt pharmaceutique |
| Auteurs : | Dalal Harkati, Auteur ; Salah Belaidi, Directeur de thèse |
| Type de document : | Thése doctorat |
| Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2015 |
| Format : | 1 vol. (101p.) / 30 cm |
| Langues: | Français |
| Langues originales: | Français |
| Mots-clés: | Indole,Modélisation moléculaire,Spectre de vibration,Effet de substitution,QSAR,ab initio,DFT. |
| Résumé : |
Dans ce travail, une recherche fondamentale et originale sur l’hétérocycle indole est réalisée dans le but est de prédire de la réactivité et de l'activité biologique du composé étudié et ses dérivés. Les paramètres structuraux, électroniques et les fréquences de vibration de l'indole ont été calculés par les méthodes: PM3, ab initio / HF et DFT/B3LYP. Les paramètres géométriques optimisés ont été trouvé en bon accord avec les valeurs expérimentales. La comparaison des fréquences de vibration obtenus par la méthode DFT/B3LYP (6-311G++ ( d,p)), sont les plus proches aux données expérimentales. La nature de type de substituant influe sur les paramètres électroniques et énergétiques de noyau de base indole. En effet, cette étude nous permet de prédire la réactivité chimique des dérivés de l’indole. Enfin, une étude qualitative de la relation structure-propriétés a été effectuée également pour une série bioactive de dérivés de l'indole. |
| Sommaire : |
LISTE DES TABLEAUX .........................................................................................................viii LISTE DES FIGURES ................................................................................................................ix LISTE DES SCHEMAS...............................................................................................................xi LISTES DES ABREVIATIONS…………………………………………………………….....xii INTRODUCTION GENERALE…………………………………………………..…...……...1 Références bibliographiques …………………………………………………………………….4 ére partie: Revue Bibliographique CHAPITRE I: MISE AU POINT DE LA SYNTHESE, LA REACTIVITE ET DE L’ACTIVITE BIOLOGIQUE DES INDOLES 1. Introduction……………………………………………………………………...…………6 2. Synthèses ……………………………………………………………………...………......6 2.1. La synthèse de Fischer………………………………………………………...…7 2.2. La synthèse de Reissert…………………………………………………...……...7 2.3. La synthèse de Madelung…………………………………………………….......8 2.4. La réaction de Bischler………………………………………………………...…8 2.5. La réaction intermoléculaire de Larock…………………...……………………...9 2.6. Réaction de Diels-Alder, cycloadditions……………………...………………….9 3. Réactivité…………………………………………………………………………………10 3.1. Réaction vis-à-vis des électrophiles…………………………………………….12 3.1.1 Protonation……………………………………………………………...12 3.1.2 Nitration ………………………………………………………………..13 3.1.3 Sulfonation…………………...………………………………………....14 3.1.4 Halogénation ……………………………………………………………15 Halogénation en position 3…………………...………………………………15 Halogénation en position 2 …………………………………….…………….16 Alkylation ……………………………………………………...……….17 Alkylation de la position 3 …………………………………………......…….17 Alkylation de la position 2 ………………………………………………..….17 3.2. Réaction vis-à-vis des nucléophiles ……………………………………..…...…18 4. L’intérêt biologique de quelque dérivé indoliques……………………………………….18 Références bibliographiques……………………………………………………...…………….24 CHAPITRE II: ASPECTS THEORIQUES DE LA MODELISATION MOLECULAIRE 1. Introduction……………………………………………...………………………………28 2. Méthodes de la modélisation moléculaire……………………….………………………29 2.1. La mécanique quantique (MQ)…………………………………..…………….29 2.1.1. Principe de base de la mécanique quantique…………………………..30 2.1.2. Les méthodes ab initio……………………………………………………....33 2.1.3. La théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT) …………………...33 2.1.4. Les méthodes semi-empiriques ………………………………….……34 2.2. La mécanique moléculaire (MM) ………………………………………….…35 2.2.1. Champ de force en mécanique moléculaire………………………...…36 2.2.2. Energie d’interaction entre atomes liés………………………………..37 2.2.2.1. Energie d’élongation (stretching)……………………………...37 2.2.2.2. Déformation des angles de valences (bending)………………..38 2.2.2.3. Energie de torsion…………………………………………..….39 2.2.3. Energie d’interaction entre atomes non liés …………………………..40 2.2.3.1. Energie de Van der Waals………………………………….….40 2.2.3.2. Interactions électrostatiques…………………………………...41 2.2.3.3. Energie de liaison hydrogène………………………………….41 2.2.4. Quelques champs de force………………………………………….....42 3. Domaine d’application de la modélisation moléculaire ………………………………..43 4. Limitation de la modélisation moléculaire ………………………………………...…...44 5. Programmes et matériels utilisés………………………………………………………..45 Références bibliographiques…………………………………………………………………..46 partie: Résultats et Discussions CHAPITRE III: ETUDES DES PROPRIETES STRUCTURALES, VIBRATIONNELLES ET ELECTRONIQUES DE L’INDOLE 1. Introduction………………………………………………………………………….….50 2. Aspects théoriques de la spectroscopie de vibration dans l’infrarouge……………..….51 2.1. Principe de la spectroscopie infrarouge……………………………………….51 2.1.1. Rayonnement électromagnétique……………………………………...51 2.1.2. L'infrarouge…………………………………………………………....53 2.1.3. Absorption infrarouge…………………………………………………53 2.2. Aspects théoriques …………………………………………………………....55 2.2.1. Les modes de vibration interne ……………………………………….55 2.2.2. Classification des modes de vibrations …………………………….…56 2.3. Les facteurs qui influencent aux fréquences de vibration……….…………….57 2.4. Application……………………..……………………………………………...58 3. Résultats et discussions……………………………………………………………...….58 3.1. Etude des propriétés structurales de l’indole………….……………………….58 3.2. Etude des propriétés vibrationnelles de l’indole …….………………………..60 3.2.1. Les modes de symétrie A’ (modes de vibration dans le plan moléculaire) ……………………….………………………………………….63 3.2.2. Les modes de symétrie A’’ (modes de vibration hors du plan moléculaire) ………………………………………………………………….65 3.3. Etude des propriétés électroniques …………………………………………..67 4. Conclusion …………………………………………………………………………….69 Références bibliographiques …………………………..…………………………………….70 CHAPITRE IV: ETUDE DE L’EFFET DE SUBSTITUTION SUR LE NOYAUINDOLE 1. Introduction …………………………………………………………………………....74 2. Principe de la théorie des orbitales moléculaires frontières (OMF)……………………74 3. Effets de substituants sur les orbitales frontières ……………………………………..75 3.1. L’effet des substituants donneurs……………………………………………..76 3.2. L’effet des substituants accepteurs …………………………………………76 4. Résultats et discussions ………………………………………………………………..77 4.1. Etude de l’effet de substituant donneur (méthyle) sur le cycle pyrrole du noyau indole…………………………………………………………………………………77 4.2. Etude de l’effet de la substitution en position C5 sur le cycle benzylique du noyau indole par les groupes (CH3, CN, F, OH, OCH3 et NH2)…………………………...78 4.3. Conclusion …………………………………………………………………...80 Références bibliographiques…………………………………………………………………81 CHAPITRE V: ETUDE QUALITATIVE DE LA RELATION STRUCTUREPROPRIETES DE DERIVES DE L’INDOLE 1. Introduction……………………………………………………………………….....84 2. Les propriétés QSAR qui caractérisant la structure moléculaire…………………….84 2.1. Volume et surface moléculaire ………………………………………………84 2.2. Polarisabilité et réfractivité molaire………………………………………….86 2.3. Energie d’hydratation ………………………………………………………..87 2.4. Coefficient de partition (Log P)……………………………………………..88 3. Les propriétés « drug-like » …………………………………………………………90 4. Résultats et discussions………………………………………………………………91 4.1. Etude des propriétés QSAR de la série des vingt molécules bioactives des Ndérivés de l’indole…….………………….……………………………………….91 4.2. Etude des propriétés « drug-like » de la série des vingt molécules bioactives des dérivés de l’indole.………………………………..……………………………96 5. Conclusion……………….…………………………………………………………..97 Références bibliographiques……...………………………………………………………….98 CONCLUSION GENERALE…………………………………………………………........95 |
| En ligne : | http://thesis.univ-biskra.dz/1215/1/Chimi_d2_2015.pdf |
Disponibilité (1)
| Cote | Support | Localisation | Statut |
|---|---|---|---|
| TCH/27 | Théses de doctorat | bibliothèque sciences exactes | Consultable |
