| Titre : | Etude quantitative des relations structure/activité des propriétés cytotoxiques de dérivés de wogonine |
| Auteurs : | Sara Feloussi, Auteur ; Nadjib Melkemi, Directeur de thèse |
| Type de document : | Monographie imprimée |
| Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2018 |
| Format : | 1 vol. (61 p.) / 30 cm |
| Langues: | Français |
| Mots-clés: | Wogonine,Activité cytotoxique,QSAR,MLR,LOO. |
| Résumé : |
une étude QSAR a été effectuée sur quarante-huit dérivés de wogonine dans la phase gazeuse et dans la phase aqueuse en utilisant les descripteurs suivants : SAG, V, log P, HBD, HBA, DM et les charges atomiques. La régression linéaire multiple (MLR) a été utilisée pour quantifier les relations entre les descripteurs moléculaires et l’activité cytotoxique des dérivxés de wogonine. Le pouvoir prédictif des modèles obtenus a été confirmé par la méthode de validation croisée LOO. Une forte corrélation a été observée entre les valeurs expérimentales et prédites de l’activité biologique, ce qui indique la validité et la qualité des modèles QSAR obtenus. |
| Sommaire : |
Liste des tableaux ...................................................................................... 1 Liste des figures .................................................................................................. 2 Liste des principales abréviations .............................................................................. 3 Introduction générale ...................................................................................... 4 I. Généralités sur le cancer et les dérivés cytotoxiques de wogonine .................................... 7 I.1 Généralités sur le cancer .................................................................................... 7 I.1.1 Rappels historiques ................................................................................. 7 I.1.2 Définition .................................................................................................. 7 I.1.3 Physiopathologie ............................................................................................... 7 I.1.4 Métastases ..................................................................................................... 9 I.1.4.1 Définition ............................................................................................. 9 I.1.4.2 Génétique des métastases ...................................................................................... 9 I.1.5 Tumeur .................................................................................................... 10 I.1.5.1 Définition .......................................................................................... 10 I.1.5.2 Types de tumeurs ............................................................................ 10 I.1.6 Mécanisme de cancérisation ....................................................................... 11 I.1.6.1 Les propriétés de la cellule cancéreuses ................................................. 12 I.1.7 Classification des médicaments utilisés en chimiothérapie anticancéreuse ............... 12 I.1.7.1 Les agents alkylants ....................................................................... 12 I.1.7.2 Les agents intercalants ............................................................................ 13 I.1.7.3 Les agents antimétabolites et les inhibiteurs de topoisomérases ......................... 13 I.2 Généralités sur les wogonines ................................................................... 14 I.2.1 Définition .................................................................................................. 14 I.2.2 La structure .............................................................................................. 14 I.2.3 Synthèse des dérivés cytoxiques de wogonine ........................................................... 14 I.2.4 Mécanismes anticancéreux pour le wogonine « Perspectives moléculaires » ............ 18 Références bibliographiques ................................................................................ 20 II. Aperçu théorique sur les méthodes de calcul utilisées (DFT, QSAR) ............................. 22 II.1 La théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT) ........................................ 22 II.1.1 Aperçu historique .......................................................................... 22 II.1.2 Principes de la théorie DFT « théorèmes de Kohn Hohenberg » ............................... 22 I.1.2.1 Première théorème (HK 1) .......................................................................... 22 I.1.2.2 Deuxième théorème (HK 2) ................................................................... 23 II.1.3 Les équations de Kohn et Sham ................................................................... 23 II.1.4 Les différentes approximations ..................................................................... 24 II.1.4.1 LDA ou approximation de la densité locale ........................................ 24 II.1.4.2 GGA ou approximation des gradients généralisée ............................ 25 II.1.5 Succès et limites de la DFT ............................................................. 25 II.2 Etude quantitative des relations structure-activité (QSAR) .................................. 27 II.2.1 Introduction ................................................................................................ 27 II.2.2 Principe de QSAR ..................................................................................... 27 II.2.3 Application de QSAR ............................................................................ 28 II.2.4 Outils et Méthodologie de QSAR ............................................................. 29 II.2.4.1 Paramètres biologiques ..................................................................... 29 II.2.4.2 Descripteurs moléculaires ............................................................. 30 II.2.4.2.1 Les descripteurs physico-chimiques ............................................ 30 II.2.4.2.2 Les descripteurs électroniques ......................................................... 30 II.2.4.2.3 Les descripteurs topologiques ......................................................... 30 II.2.4.3 Modèles statistiques ............................................................................. 31 II.2.5 Régression linéaire multiple ....................................................................... 31 II.2.5.1 Description de la méthode ................................................................ 31 II.2.5.2 Test de la signification totale de la régression ........................................ 33 II.2.5.3 Validations des modèles ................................................................ 34 II.2.6 Domaine d’applicabilité ................................................................ 34 II.3 L’activité biologique ............................................................................ 36 II.3.1 Découverte des médicaments ........................................................................ 36 II.3.2 Les différentes cibles des médicaments ........................................................ 36 II.3.3 Les tests biologiques .............................................................................. 36 II.3.3.a Tests in vivo............................................................................ 36 II.3.3.b Tests in vitro ................................................................................ 36 II.3.4 Etude de la liaison ligand-récepteur ......................................................... 37 Références bibliographiques ................................................................................ 38 III. Résultats et discussion ........................................................................ 41 III.1 Etude quantitative des relations structure-activité (QSAR) des propriétés cytotoxiques d’une série de dérivés de wogonine ...... 41 III.1.1 Introduction ................................................................................................. 41 III.1.2 Méthodologie ........................................................................................ 41 III.1.2.1 Base de données............................................................................... 41 III.1.2.2 Sélection des descripteurs et méthodes de calcul ................................. 45 III.1.3 Développement des modèles QSAR ................................................... 50 III.1.4 Validation des modèles QSAR .......................................................... 53 III.1.4.1 Validation interne ........................................................................... 53 III.1.4.2 Validation externe .................................................................. 54 III.1.5 Prédiction de l’activité ............................................................... 54 Références bibliographiques .......................................................................... 58 Conclusion générale .............................................................................................. 60 Annexe .................................................................................... 61 |
Disponibilité (1)
| Cote | Support | Localisation | Statut |
|---|---|---|---|
| MCH/343 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Consultable |
