| Titre : | Étude Par Docking Moléculaire Des Dérivés De Pyrazole Tétrasubstituée Comme Inhibiteurs De la Cycloxygénase-2 |
| Auteurs : | Karima Ghaza, Auteur ; Mebarka Ouassaf, Directeur de thèse |
| Type de document : | Monographie imprimée |
| Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2018 |
| Format : | 1 vol. (77 p.) / 30 cm |
| Langues: | Français |
| Mots-clés: | Molegro Virtuel Docker ; Docking moléculaire ; Inhibiteur la cyclooxygénase-2 ; Interaction hydrophobique ; Liaison hydrogène. |
| Résumé : |
L'inflammation fait partie de la réponse biologique complexe des tissus vasculaires aux stimuli nocifs, tels que les agents pathogènes, les cellules endommagées ou les irritants. La cyclooxygénase-2 (COX-2) joue un rôle important dans l'inflammation et constitue ainsi une cible moléculaire prometteuse pour le traitement de nombreuses maladies inflammatoires. Le but de cette étude est de révéler les interactions de mode de liaison et de liaison hydrogène de nouveau pyrazoles avec l'enzyme Cyclooxygenase-2. Dans la présente étude nous décrivons les études de docking moléculaire pour une séries des 30 nouveaux pyrazoles contre COX-2 en utilisant l'outil MolDock (Le logiciel Molegro Virtuel Docker (MVD)). Une étude de docking moléculaire a suggéré que L9, L10, L14, L22 et L24 étaient de puissants inhibiteurs de COX-2, Les résultats de docking ont indiqué que les meilleurs des composés ont montré des interactions de liaison hydrogène avec Phe518, Tyr355 et Lle 517 et des contacts hydrophobes avec His90, Tyr385, Trp387 et Ser353. . De plus, Molinspiration et les serveurs Web ADMETSAR permettent de calculer respectivement les propriétés ADMET et physico-chimiques des composés cibles. Aucun des cinq meilleurs composés n'a violé les paramètres de Lipinski et d'admet, ce qui en fait des agents potentiellement prometteurs pour les activités biologiques. Ces résultats fournissent une stratégie potentielle pour développer des inhibiteurs de la COX-2. |
| Sommaire : |
SOMMAIRE Remerciement. Liste des abréviations. Liste des figures. Liste des tableaux. Introduction générale 2 Etude bibliographique Chapitre I : Généralités I.1. Introduction………………………………………………….. 5 I. 2. le noyau pyrazole …………………………………………… 5 I. 3. Synthése des pyrazole……………………………… 6 I. 3. 1. Synthèse de pyrazoles à partir d’époxydes………………………….. 6 I. 3.2. Synthèse des pyrazoles par la méthode monotope………………… 6 I. 3.3. Synthèse des nouveaux 1, 3 ,5-triazine-pyrazoles…………………… 6 I. 3. 4. Synthèse des dérivés pyrazoliques à partir du Trifliorométhylénaminone avec les hydrazines monosubstituées ……….. I. 3.5. Réaction non conventionnelle …………………………………….… 7 I .3.5.1. Cycloadition de la sydnone avec les alcynes sous irradiation micro-ondes…………………………………………………………………… I. 3.6. Synthèse des pyrazoles à partir de diazocomposés………..…………. 7 I. 3.7. Synthèse de formylpyrazoles ………………………..………………. 7 I. 3.8. Synthèse de carboxaldehyde pyrazole ………….…………………… 8 I. 3.9. Synthèse de pyrazoles substitués ……………….……………………. 8 I. 3.10. Synthèse de dérivés de pyrazoles …………………..………………. 8 I .4. Intérêts biologiques des pyrazoles…………..………………. 11 I .5. La Cyclooxygénase-2 (COX-2) ……………………………. 14 I .5.1. Définition…………………………………………………………….. 14 I .5.2. Le gène …………………………………………………… 15 I .5.3.Structure ………………………………………………….. 15 I .5.4. Site actif de la COX-2…………………………………….. 16 I .5.5. Rôle de la Cyclooxygénase-2 …………….………….. 17 I .5.6. Mécanismes l’activité de COX-2 …………………..……. 18 I .5.7. Fonction de la cyclooxygénase…………………...………. 20 I .5.8. La COX-2 et l’inflammation……………………………… 22 I .5.9. Les inhibiteurs spécifiques de la cyclooxygénase-2 ……. 22 Chapitre II : LES méthodes de modélisation des interactions protéineligand II .1. Méthodes de modélisation moléculaire ………………….. 25 II .1.1. Introduction …………………………………………………………. 25 II .1.2. La mécanique moléculaire………………………………………..…. 26 II .1.2.1. Principes théoriques………………………………………………. 26 II .1.2.2. Modélisation par champs de force ………………………………. 27 II .1.3. Les simulations de dynamique moléculaire ………………………. 28 II .1.3.1. Principes théoriques ……………………………………………… 28 II .1.3.2. Calcul de dynamique moléculaire……………………..…………. 29 II .1.4. Minimisation d’énergie (optimisation de géométrie) ……………… 29 II .2. Technique basée sur la structure de la protéine 30 II .3. L’évolution des structures des protéines 31 a) La résolution…………………………………………………………. 32 b) Le facteur R……………………………………………………...…… 33 c) Choix d’une structure cristallographique………………………….. 33 d) Facteur d’agitation thermique…………………………………….…. 33 e) Détermination du site actif………………………………………………. 34 II .4. Interaction protéine-ligand ………………………….…… 34 II .4.1. Intéractions de Van Der Waals ……………………………...……. 34 II .4.2. Ponts hydrogène ……………………………………………………... 35 II .4.3. Interactions électrostatiques ………………………………………… 35 II .5. Principes théoriques de docking moléculaire…………….. 35 II .6. Algorithmes de docking……………………………………. 36 II .7. Choix de logiciel de MolDock (MVD)……………………. 37 II .8. Protocole général de docking……………………………… 38 II .9. ADME ……………………………………………………. 39 Chapitre III: Etude pratique III .1. Introduction ……………………………………………….. 42 III .2. Préparation de l’enzyme …………………………………. 43 III .3. Préparation des ligands…………………………………... 44 III .4. Détection des cavités……………………………….…….. 47 III .5. Etude de docking moléculaire …………..……. 49 III .6. Résultats du Docking moléculaire ………………………… 49 III .7. Les règles de Lipinski……………………………………… 59 III .7.1. Interprétation ……………………………………………………… 60 III .8. Admet (absorption, distribution, métabolisme, élimination et toxicité) ………………… Conclusion générale…………………………………………….. 65 Références……………………………………………………….. 68 |
Disponibilité (1)
| Cote | Support | Localisation | Statut |
|---|---|---|---|
| MCH/354 | Mémoire master | bibliothèque sciences exactes | Consultable |
