| Titre : | Etude basée sur la DFT des relatios structure activité d'une série bioactive de 2 aminothizol 4(5h) one |
| Auteurs : | IZZGHECHE Khouloud IZZGHECHE, Auteur ; Youcef Boumedjane, Directeur de thèse |
| Type de document : | Mémoire magistere |
| Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2017 |
| ISBN/ISSN/EAN : | MCH/335 |
| Format : | 1VOL.(58p) / ill.couv.ill.en coul / 30cm |
| Langues: | Français |
| Langues originales: | Français |
| Mots-clés: | aminothiazol-4(5H)-one, DFT, QSAR, MLR |
| Résumé : |
Dans ce travail, une recherche fondamentale et originale a été réalisée sur la molécule de 2-aminothiazol-4(5H)-one dont le but est d’étudier de la réactivité chimique et l'activité biologique des dérivés de 2-aminothiazol-4(5H)-one. Des concepts chimiques et des indices de réactivité dérivant de la théorie de la fonctionnelle de densité (DFT/B3LYP/6-311++G(d,p)) ont été utilisé pour prédire les sites réactifs des systèmes moléculaires étudiés . Une étude QSAR a été effectuée sur 18 dérivés de 2-aminothiazol-4(5H)-one dans les cellules de cancer du poumon A549 et H460. Les descripteurs utilisés sont :le moment dipolaire, le gap énergétique, les charges atomiques et les indices de réactivité ( et ). La régression linéaire multiple (MLR) a été utilisée pour quantifier les relations entre les descripteurs moléculaires et l’activité antiprolifératif des dérivés de 2-aminothiazol-4(5H)-one . Le pouvoir prédictif des modèles obtenus a été confirmé par la méthode de validation croisée LOO. Une forte corrélation a été observée entre les valeurs expérimentales et prédites des activités biologiques, ce qui indique la validité et la qualité des modèles QSAR obtenus. |
| Sommaire : |
Liste des tableaux ................................................................................................................... 1 Liste des figures ...................................................................................................................... 2 Liste des principales abréviations ...................................................................................... 3 Introduction générale ........................................................................................................... 5 I.1. La Théorie de la Fonctionnelle de la Densité (DFT) ................................................... 8 I.1.1.Introduction .................................................................................................................. 8 I.2. Généralités sur les méthodes de chimie quantique ...................................................... 9 I.2.1.L’équation de Schrödinger ......................................................................................... 9 I.2.2 .L’approximation de Born-Oppenheimer ................................................................ 9 I.2.3.Approximation de Hartee-Fock ............................................................................... 10 I.3. La théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT) ..................................................... 11 I.3.1. Fondement de la théorie ........................................................................................... 11 I.3.1.1.première théorème de Honbenberg et kohn ..................................................... 11 I.3.1.2.Deuxième théorème de Honbenberg et kohn ................................................... 12 I.3.2.Méthode de Kohn et Sharm ..................................................................................... 12 I.3.3.Approximation de la densité locale LDA .............................................................. 13 I.3.4.Approximation de la densité de spin locale LSDA ............................................... 13 I.3.5.Approximation de Gradient généralisé (GGA) ..................................................... 14 I.4.Fonctionnelle hybride B3LYP ....................................................................................... 14 I.5.Bases d’orbitales atomiques .......................................................................................... 15 I.6. comparaison sommaire des différentes méthodes ...................................................... 16 I.7. Conclusion ...................................................................................................................... 17 I.8. Références bibliographiques ......................................................................................... 18 II.1.Introduction .................................................................................................................... 20 II.2.Théorie des orbitales moléculaires frontières FMO ................................................. 20 II.2.1.Introduction ........................................................................................................... 20 II.2.2.Principe de la FMO ............................................................................................... 21 II.2.3.Les principales hypothèses de la théorie FMO ................................................ 21 II.2.4.Critiques de la FMO .............................................................................................. 22 II.3. Principe HSAB (Hard and soft Acids and bases) global ........................................ 22 II.4. Concepts chimiques et indices de réactivité dérivant de la DFT ............................ 23 II.4.1.Concepts et indices globaux de réactivité ........................................................ 23 II.4.2. Indices locaux de réactivité dérivant de la DFT conceptuelle ..................... 27 II.5. Les déférents indices locaux de réactivité dérivant de la DFT conceptuelle ......28 II.6. Etude quantitative des réactions structure –activité (QSAR) .................................. 30 II.6.1. Introduction .......................................................................................................... 30 II.6.2. Généralités sur la modélisation QSPR /QSAR ................................................. 30 II.6.3. Principe des méthodes QSPR/QSAR................................................................. 31 II.6.4. Méthodologie générale d’une étude QSPR/QSAR ......................................... 32 II.6.5. Outils et techniques de QSAR ............................................................................ 33 II.6.5.1. Paramètres biologique .................................................................................. 33 II.6.5.2. Descripteurs moléculaires .......................................................................... 33 II.6.5.3. Les descripteurs physico-chimiques .......................................................... 34 II.6.5.4. Les descripteurs électroniques ................................................................... 34 II.6.5.5. Les descripteurs topologiques ..................................................................... 34 II.7. Importance des descripteurs ........................................................................................ 34 II.8. Méthodes d’analyse des données ................................................................................ 35 II.9. Statistique et analyse des données .............................................................................. 35 II.9.1. Introduction ............................................................................................................ 35 II.9.2. Régression linéaire multiple (MLR) ................................................................... 36 II.9.3. Estimation des paramètres du modèle ............................................................... 36 II.9.4. Confiance accordée aux résultats ........................................................................ 37 II.9.5. Tests sur le modèle linéaire ................................................................................. 37 II.9.6. Test de la signification globale de la régression (F-Fisher ) ............................ 38 II.9.7. Sélection des variables et choix du modèle ....................................................... 38 II.9.7.1. Critères de comparaison de modèle .......................................................... 38 II.9.7.1.1. Limitation du coefficient de détermination ................................ 38 II.9.7.1.2. Coefficient de détermination ajusté ajusté ................................ 39 II.9.7.1.3. Critère de validation croisée : PRESS .............................................. 39 II.9.8. Validation d’un modèle ..................................................................................... 39 II.10. Application des méthodes QSPR/QSAR ................................................................. 40 II.11. Conclusion .................................................................................................................. 40 II.12. Références bibliographiques ..................................................................................... 41 III.1. Introduction .................................................................................................................. 44 III.2. Cellules de cancer du poumon A549 ....................................................................... 44 III.3.Méthodologie de calcul ............................................................................................... 45 III.4.Etude des propriétés structurales et électroniques du noyau de base .................... 45 III.5.Etude de réactivité chimique de 2-aminothiazol-4(5H)-one .................................. 48 III.5.1.Indices et descripteurs de réactivité ................................................................ 48 III.5.1.1.Indices globaux de réactivité .................................................................. 48 III.5.1.2.Indics locaux de réactivité ....................................................................... 49 III.6.Etude quantitative des relations structure –activité (QSAR) des propriétés antiprolifératif d’une série des dérivés de 2-aminothiazol-4-one ................. 51 III.6.1.Méthodologie ..................................................................................................... 51 III.6.1.1.Base de données ....................................................................................... 51 III.6.2. Sélection des descripteurs et méthodes de calcul ......................................... 52 III.6.3.Développement des modèles QSAR ............................................................... 54 III.6.4.Validation des modèles QSAR ......................................................................... 58 III.7. Conclusion .................................................................................................................... 61 III.8.Références bibliographiques ...................................................................................... 62 Conclusion générale ........................................................................................................... 63 |
| Type de document : | Mémoire master |
Disponibilité (1)
| Cote | Support | Localisation | Statut |
|---|---|---|---|
| MCH/335 | Mémoire | bibliothèque sciences exactes | Consultable |
