| Titre : | etude des propriétés QSAR des dérives de coumarine |
| Auteurs : | Boussourdi Amina Boussourdi, Auteur ; Saida Khamouli , Directeur de thèse |
| Type de document : | Mémoire magistere |
| Editeur : | Biskra [Algérie] : Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mohamed Khider, 2017 |
| ISBN/ISSN/EAN : | MCH/318 |
| Format : | 1VOL.(125p) / ill.couv.ill.en coul / 30cm |
| Langues: | Français |
| Langues originales: | Français |
| Mots-clés: | coumarine, Ab-initio , DFT, QSAR, Lipinski, RML. |
| Résumé : |
Ce travail s’inscrit dans la perspective d’une évaluation qualitative et quantitative de la relation structure-activité des dérives de coumarine. Les paramètres structuraux, électroniques de coumarine ont été calculés par les méthodes: PM3, ab initio / HF et DFT/B3LYP. La nature de type de substituant influe sur les paramètres électroniques et énergétiques de noyau de base de coumarine. En effet, cette étude nous permet de prédire la réactivité chimique des dérivés de coumarine. Les études qualitatives de relation structure-activité ont été effectuées sur treize dérivés de coumarine, en utilisant la règle de Lipinski, la règle de Veber, l’efficacité de ligand (LE) et l’efficacité lipophylique de ligand (LLE). La régression linéaire multiple (MLR) a été utilisée pour quantifier les relations entre les descripteurs moléculaires et la propriété de l’activité anti (gGAPDH) contre T. cruz des dérives de coumarine. La prédictivité du modèle a été estimé par la validation croisée par la méthode leave-one-out. Une forte corrélation entre les valeurs de l’activité expérimentale et prédite a été observée, indiquant la validation et la bonne qualité des modèles QSAR établis. |
| Sommaire : |
Liste des tableaux…………………………………………………………… vi Liste des figures ……………………………………………………………… v Liste des abréviations………………………………………………………..iv Introduction générale…………………………………………………………1 1ere partie : Revue Bibliographique CHAPITRE I : Généralités sur la réactivité de coumarine I.1-Introduction …………………………………………………………………5 I.2-Définition ……………………………………………………………………5 I.3-Classification………………………………………………………………...6 I.3.1- Coumarines Simples……………………………………………..7 I.3.2- Furanocoumarines……………………………………………….8 I.3.3- Pyranocoumarines……………………………………………….9 I.3.4- Dicoumarines (coumarines dimériques)………………………...10 I.3.5- Tricoumarines (coumarines trimériques)………………………...10 I.4- L’activité biologique des coumarines……………………………………...10 I.5- Descriptif général des méthodes de synthèse des coumarines………..…....11 I.6- Propriétés physico-chimiques des coumarines…………………………….16 I.7- Propriétés biologiques …………………………………………………….16 I.8- Intérêt des coumarines……………………………………………...…….17 I.9- Trypanosomiases humaines américaines………………………………….17 I.9.a- Définition des trypanosomiases humaines américaines………...17 I.9.b- Répartition………………………………………………………18 I.9.c- Signes et symptômes………………………………………….. 18 I.9.d- Transmission……………………………………………………18 Référence………………………………………………………………………20 CHAPITRE II : MODELISATION MOLECULAIRE II.1- Introduction………………………………………………………………23 II.2- Description de la méthode………………………………………………. 24 II.2.1-la modélisation moléculaire………………………………….24 II.2.2-Base de la chimie quantique………………………………..25 II.2.2.1- Equation de Schrödinger………………………....25 II.3- Représentation des méthodes de calcul………………………………. 26 II.3.1-La mécanique quantique (MQ)…………………………….. .26 II.3.1.1-Méthode ab-initio……………………………….. .26 II.3.1.2-Théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT)…………………………………………… ...27 II.3.1.3-Les déférents indices locaux de réactivité dérivant de la DFT conceptuelle…………………………… ...27 II.3.1.4- méthode de Hartree-Fock…………………….. …..29 II.3.2- Méthodes semi-empiriques……………………………. …31 II.4-Mécanique moléculaire(MM)………………………………………. ….34 II.4.1- Champ de force………………………………………... ….34 II.5-La dynamique moléculaire ………………………………………… ….36 II.5.1- Le principe de la Dynamique Moléculaire (DM)………….. 36 Référence………………………………………………………………….….. 38 2éme partie : Résultats et Discussions CHAPITRE III : Etude de la géométrie et des propriétés électroniques de Coumarine. III.1- Introduction……………………………………………………………...42 III.2- Etude des propriétés structurales et électroniques de noyau de base de Coumarine……………………………………………………………....43 III.2.1- Etude du noyau de base de coumarine …………..........43 III.2.2- L’interprétation des résultats obtenus……………...….46 III.3- Etude de l’effet de substitution sur le squelette de noyau de base de la Coumarine……………………………………………………………... 47 III.3.1- Effet d’un substituant électro-donneur (méthyle)...........49 III.3.2-Effet d’un substituant électro-attracteur (chlorure)…… 50 III.4- Descripteurs locaux (Fonction de Fukui) …………………………….…52 Référence……………………………………………………………………….57 CHAPITRE IV : Etude qualitative et quantitative des propriétés QSAR d’une série bioactif de coumarine IV.1- Introduction……………………………………………………………60 IV.2- Les propriétés QSAR qui caractérisant la structure moléculaire………61 IV.2.1- Structures chimiques des dérivés de coumarine…..… 64 IV.3- étude qualitative des propriétés QSAR d’une série dérivé de coumarine………………………………………………………………………66 IV.3.1- Étude des propriétés physico-chimiques des dérivés de Coumarine…………………………………………………..….66 IV.3.2-Les règle de lipinski…………………………………....69 IV.3.3- Les règle de Veber…………………………………….71 IV.3.4- Efficacité de ligand (LE)……………………………...73 IV.3.5- Efficacité lipophile de ligand (LLE ou bien LipE)……75 IV.4- Etude quantitative de la relation structure-activité des dérivés de la Coumarine……………………………………………………………....77 IV.5- Le modèle QSAR……………………………………………………….77 IV.5.1-Résultats et discussion………………………………………………... 78 IV.5.2- Validation de modèle QSAR……………………….…80 Référence……………………………………………………………………....84 Conclusion général……………………………………………………………88 |
| Type de document : | Mémoire master |
Disponibilité (1)
| Cote | Support | Localisation | Statut |
|---|---|---|---|
| MCH/318 | Mémoire | bibliothèque sciences exactes | Consultable |
