| Titre : | Etude des microorganismes antagonistes (Trichoderma ssp.) du fusariose (Fusarium spp.), principale maladie fongique des cucurbitacées dans la région de Biskra. |
| Auteurs : | FADLAOUI Soumaia, Auteur ; Mohamed Seghir Mehaoua, Directeur de thèse |
| Type de document : | document multimédia |
| Editeur : | Biskra [Alger] : Département des scienes agronomiques, université de Biskra, 2024-2025 |
| Format : | 125 p. |
| Langues: | Français |
| Mots-clés: | Cucurbitacées, Fusarium, Trichoderma, Pathogénicité, Biocontrôle, Algérie. |
| Résumé : |
La culture des cucurbitacées revêt une grande importance économique en Algérie, notamment dans la région de Biskra où elle contribue de manière substantielle à l'économie agricole locale et nationale. Cependant, cette filière est fragilisée par la fusariose causée par le champignon Fusarium spp. L'objectif de cette thèse est d'étudier ce phatogène afin d'identifier des agents de biocontrôle efficaces sous forme de souches antagonistes du genre Trichoderma, dans le but de proposer des solutions de lutte durable contre cette maladie. Un diagnostic de la situation a été réalisé via des enquêtes menées auprès de la DSA, du MADR, des agriculteurs et des grainetiers de la région afin d'analyser l'importance économique de la culture, la situation socio-économique des producteurs et l'état actuel de l'infection. Des échantillons de plantes malades et des sols ont ensuite été collectés dans différentes zones pour isoler les champignons présents (Fusarium et Trichoderma). Les souches fongiques isolées ont été caractérisées morphologiquement et identifiées moléculairement par amplification et séquençage de l'ITS et du gène TEF-1 suivi d'une analyse phylogénétique par la méthode UPGMA à l'aide du logiciel MEGA 11. Le pouvoir pathogène des isolats de Fusarium spp. et le pouvoir antagoniste des isolats de Trichoderma spp. ont été évalués en étudiant la vitesse de croissance mycélienne, le test de pathogénicité des Fusarium spp sur des grains de melon dans des boîtes de Petri et le test de confrontation directe des isolats de Trichoderma spp. contre différentes espèces de Fusarium. Vingt-cinq isolats de Fusarium et sept isolats de Trichoderma ont été isolés. Huit espèces de Fusarium spp et quatre espèces de Trichoderma spp. ont été identifiées. Les résultats ont montré que 16% des espèces de Fusarium étaient F. solani, 4% F. f. falciforme, 20% F. oxysporum, 28% F. equiseti, 12% F. nygamai, 8% F. prolifératum et 4% F. brachygibbosum. Les espèces de Trichoderma comprenaient deux isolats de T. virens, un isolat de T. harzianum, un isolat de T. asperellum et trois isolats de T. rifaii. Cette dernière est signalée pour la première fois en Algérie. Les résultats ont également montré la pathogénicité de certains isolats de Fusarium inhibant plus de 53% de la germination. Les espèces de Trichoderma ont démontré une grande efficacité en tant qu'agents de biocontrôle contre le Fusarium, avec un taux d'inhibition supérieur à 70%. Ce travail a permis de caractériser les Fusarium infectant les cucurbitacées dans la région de Biskra et de proposer des agents de biocontrôle prometteurs du genre Trichoderma sur la base de leurs performances in vitro. L'utilisation de souches sélectionnées de Trichoderma comme biopesticides ouvre des perspectives pour une lutte plus durable contre cette contrainte majeure |
| Note de contenu : |
Introduction Générale ................................................................................................................. 2 Chapitre I : Donnés générale sur la Fusariose des cucurbitacées ............................................. 13 1. Introduction ................................................................................................................... 13 2. Matériel et Méthodes ..................................................................................................... 13 2.1. Enquête auprès de DSA et MADR ........................................................................ 14 2.2 . Enquête auprès des grainetiers ............................................................................... 14 2.3. Enquête auprès des agriculteurs ............................................................................. 15 3. Résultats ........................................................................................................................ 18 3.1. Importance économique de la culture des cucurbitacées dans la région de Biskra 18 3.2. Situation socio-économique des agriculteurs ......................................................... 20 3.3. Analyse de la culture de cucurbitacées à Biskra .................................................... 22 3.4. Données générales sur les infections des cucurbitacées par le Fusariose .............. 23 3.5. Défi de la transition des fongicides chimiques au alternatives biologique contre le Fusarium ........................................................................................................................... 25 4. Discussion ..................................................................................................................... 30 5. Conclusion ..................................................................................................................... 34 Chapitre II : Isolement et identification des agents pathogènes et antagonistes. ..................... 36 1. Introduction ................................................................................................................... 36 2. Matériel et méthodes ..................................................................................................... 37 2.2. Collecte de matériel biologiques 2.3. Isolement et purification des champignons pathogènes et antagonistes. ................... 38 2.4. Caractérisation morphologique des isolats pathogènes et antagonistes ..................... 39 2.6. Caractérisation moléculaire des champignons ........................................................... 41 2.7. Analyse phylogénétique ............................................................................................. 43 3. Résultats ........................................................................................................................ 46 3.1. Isolement de l’agent pathogène « Fusarium spp. » ............................................... 46 3.2. Isolement de l’agent antagoniste « Trichoderma spp. » ........................................ 46 3.3. Caractérisations morphologiques des isolats de Fusarium spp. ............................ 48 3.4. Caractérisations morphologiques des isolats de Trichoderma spp. ....................... 49 3.5. Identification moléculaire des isolats de Fusariumspp. ......................................... 51 3.6. Identification moléculaire des isolats de Trichodermaspp. ................................... 51 3.7. Analyse phylogénétique des espèces de Fusarium ................................................ 52 3.8. Analyse phylogénétique des espèces de Trichoderma ........................................... 53 4. Discussion ..................................................................................................................... 57 5. Conclusion ..................................................................................................................... 60 Chapitre III : Pouvoir pathogène des Fusarium spp. et antagoniste des Trichoderma spp. .... 62 1. Introduction ................................................................................................................... 62 2. Matériel et Méthodes ..................................................................................................... 63 2.1. Vitesse de croissance des isolats de Fusarium et de Trichoderma identifiées ........... 63 2.2. Pouvoir pathogène des isolats de Fusarium identifiées. ............................................ 63 2.3. Pouvoir antagoniste des isolats de Trichoderma identifiées ...................................... 65 2.4. Analyse statistique ..................................................................................................... 66 3. Résultats ........................................................................................................................ 67 3.1. Evaluation de la vitesse de croissance ....................................................................... 67 3.2. Evaluation du pouvoir pathogène des isolats de Fusarium spp. ................................ 68 3.3. Evaluation du pouvoir antagoniste des isolats de Trichoderma spp. ......................... 70 4. Discussion ..................................................................................................................... 77 5. Conclusion ..................................................................................................................... 80 Conclusion générale ................................................................................................................. 82 Liste des références bibliographiques ...................................................................................... 88 Annexe 01Chapitre 01 : Statistiques montrants l’importance économique de la culture des cucurbitacées au niveau nationale et régionale (Cas de Biskra) ............................................ 109 Annexe 02 Chapitre 03 : Tableau analyse de la variance ANOVA à 95% ........................... 110 Annexe 03 Chapitre 03 : Evaluation du pouvoir pathogène es isolats de Fusariumspp. Par le teste de germination. .............................................................................................................. 111 Annexe 04 Chapitre 03 : Evaluation du pouvoir antagoniste des isolats de Trichodermaspp. Par le teste de confrontatio ..................................................................................................... 112 |
Exemplaires (1)
| Cote | Support | Localisation | Disponibilité |
|---|---|---|---|
| DOC-AGR/92 | These doctorat | bibliotheque departement agronomie | disponible Disponible |
