Titre : | Caractérisation génétique et pharmacologique du pollen et des pennes du palmier dattier (Phoenix dactylifera L.) dans la région de Biskra |
Auteurs : | Ourida Benouamane, Auteur ; Abdelaziz BENAZIZA, Directeur de thèse |
Type de document : | document multimédia |
Editeur : | Biskra [Alger] : Département des scienes agronomiques, université de Biskra, 2022-2023 |
Format : | 152 p. |
Langues: | Français |
Mots-clés: | Date palm, pollen, leaves, the genetic variability, ISSR and RAPD, LC×LC, HPLC-MS, polyphenolic fingerprints, LDA, antibiotic properties. |
Résumé : | individuals within a cultivar was lower than the genetic variability of individuals belonging to different cultivars. This confirms genetically the concept of classification as cultivars. On the other hand, different parts of the plant are known for their medicinal properties. These properties are investigated further, to identify, quantitativelly, the main compounds present in methanol, acetonic and ethanolic extracts of leaves and pollen. Polyphenolic fractions were extracted and characterized in terms of antioxidant activity and total polyphenols (TPC), flavonoids content (FC) and condensed tannins (CT). All extracts had antioxidant activity and high TPC, FC and CT values, with DN being the cultivar with the best results. The extracts were analyzed by HPLC-MS, 21 and 23 phenols were identified, respectively, in leaf and pollen extracts. The LC×LC analysis provided polyphenolic fingerprints useful for building an LDA model and classifying date palm leaves according to their cultivar. Finally, all fractions were tested for their antibiotic properties. All extracts were active against Gram-positive bacteria but not against Gram-negative bacteria. Pollen extracts were the most active. As a result, leaf and pollen extracts have shown great promise for both their antioxidant and antibiotic properties. |
Note de contenu : |
Remerciements
Dédicace Liste des tableaux ................................................................................................................................ II Liste des figures ................................................................................................................................. III Liste des abréviations……………………………………………………………………………….IV Liste des annexes……………………………………………………………………………………V Introduction générale…………………………………………………………………………………1 Partie 1 : Synthèse Bibliographique Chapitre I : Généralités sur le palmier dattier 1 Présentation de l’espèce ............................................................................................................... 6 2 Classification botanique ............................................................................................................... 6 3 Classification selon Munier . ........................................................................................................ 7 4 Origine et histoire ......................................................................................................................... 7 5 Description morphologique du palmier dattier ............................................................................ 7 5.1 L’appareil végétatif ............................................................................................................... 9 5.1.1 Les palmes .............................................................................................................. 9 5.1.2 Le stipe ................................................................................................................... 9 5.1.3 Les racines ............................................................................................................ 10 5.1.4 La couronne (frondaison) ..................................................................................... 5.1.5 Les inflorescences ................................................................................................ 11 5.1.6 Les organes floraux .............................................................................................. 11 5.1.7 Le fruit .................................................................................................................. 12 6 Répartition géographique ........................................................................................................... 13 6.1 Dans le monde .................................................................................................................... 13 6.2 En Algérie ........................................................................................................................... 14 7 L'importance économique .......................................................................................................... 14 7.1 Au niveau mondial .............................................................................................................. 14 7.2 En Algérie ........................................................................................................................... 14 7.3 Biskra .................................................................................................................................. 15 Chapitre II: Les marqueurs moléculaires et les ressources phytogénétiques du palmier dattier 1 Introduction ................................................................................................................................ 17 2 Biodiversité ................................................................................................................................ 17 3 Les marqueurs moléculaires ....................................................................................................... 18 3.1 Définition ............................................................................................................................ 18 3.2 But d’utilisation .................................................................................................................. 18 3.3 Types des marqueurs .......................................................................................................... 19 3.3.1 RFLP : Restriction Fragment Length Polymorphism .......................................... 19 3.3.2 SSR : Simple Sequence repeats ............................................................................ 19 3.3.3 ISSR : Inter Simple Sequence Repeats ................................................................ 20 3.3.4 AFLP: Amplified fragment length polymorphism ............................................... 21 3.3.5 SNP : Single Nucleotide Polymorphism .............................................................. 22 3.3.6 RAPD: Random Amplification of Polymorphic DNA ........................................ 22 Chapitre III : Composition chimique et activités biologiques 1 Introduction ................................................................................................................................ 25 2 La composition chimique des polyphénols ................................................................................ 25 2.1 Définition ............................................................................................................................ 25 2.2 Rôles des polyphénols ........................................................................................................ 26 2.3 Classification des composés phénoliques ........................................................................... 26 2.3.1 Les acides phénoliques ......................................................................................... 27 2.3.2 Les flavonoïdes .................................................................................................... 29 2.3.3 Les tanins.............................................................................................................. 32 2.3.4 Les stilbènes ......................................................................................................... 33 2.3.5 Les lignanes .......................................................................................................... 33 2.3.6 Les saponines ....................................................................................................... 33 2.4 Méthodes d’analyse ............................................................................................................ 33 2.4.1 HPLC .................................................................................................................... 33 2.4.2 Principe................................................................................................................ 35 2.4.3 Notions fondamentales ......................................................................................... 35 2.4.4 Appareillage ......................................................................................................... 37 2.5 Chromatographie 2D ........................................................................................................... 38 2.6 Analyse discriminante linéaire (LDA) ................................................................................ 40 2.7 Stress oxydatif .................................................................................................................... 42 2.8 Antioxydants ....................................................................................................................... 43 2.8.1 Définition ............................................................................................................. 44 2.8.2 Mesure de la capacité d'un antioxydant ............................................................... 45 2.8.3 Les travaux sur les polyphénols ........................................................................... 45 1 Introduction ................................................................................................................................ 48 2 Méthode d’évaluation de l’activité antibactérienne ................................................................... 48 2.1 Techniques en milieu liquide (méthode de dilution) .......................................................... 48 2.1.1 Méthode des disques de Sarbach .......................................................................... 48 2.1.2 Méthode de Maruzuella ........................................................................................ 48 2.1.3 Dilution en bouillon ............................................................................................. 49 2.1.4 Dilution en gélose................................................................................................. 49 2.2 Techniques en milieu solide (méthode de la diffusion en disque) ...................................... 49 2.2.1 Méthode de Vincent ............................................................................................. 49 2.2.2 Méthode de Morel et Rochaix .............................................................................. 49 2.2.3 Méthode en micro-atmosphère ............................................................................. 49 2.3 Détermination de la Concentration Minimale Inhibitrice (CMI) et de la Concentration Minimale Bactéricide (CMB). ..................................................................................... 2.4 Mode d’action contre les bactéries ..................................................................................... Partie 2 : Partie Expérimentale Etude I. Caractérisation génotypique de dokkars Phoenix dactylifera L. .................................. 52 1 Préambule ................................................................................................................................... 53 2 Introduction ................................................................................................................................ 54 3 Matériel et méthodes .................................................................................................................. 56 3.1 Région d’échantillonnage. .................................................................................................. 56 3.2 Materiel végétal .................................................................................................................. 56 3.3 Caractérisation moléculaire. ............................................................................................... 56 3.3.1 Inter Simple Sequence repeats (ISSR) ................................................................. 56 3.3.2 Random Amplification of Polymorphic DNA (RAPD) ....................................... 57 4 Analyse statistiques .................................................................................................................... 57 5 Résultats et Discussion ............................................................................................................... 58 5.1 Analyse moléculaire L’ISSR .............................................................................................. 58 5.1.1 ISSR avec l’amorce biba1 : .................................................................................. 58 5.1.2 ISSR avec amorce biba2 : .................................................................................... 5.2 Analyse de RAPD ............................................................................................................... 66 5.2.1 Analyse moléculaire RAPD L’amorce A10 ......................................................... 66 5.2.2 Analyse moléculaire RAPD pour L’amorce A12 ................................................ 68 5.3 Combinaison des marqueurs ..................................................................................... 5.4 AMOVA ..................................................................................... 5.4.1 Resultats de l’Analyse Moléculaire de la Variance ............................................. 73 6 Conclusion ..................................................................................... Etude II. Phytochimie et effet antioxydant ................................................................................... 1 Introduction ................................................................................................................................ 77 2 Matériel et méthodes .................................................................................................................. 79 2.1 Matériel végétal .................................................................................................................. 79 2.2 Produits chimiques .............................................................................................................. 79 2.3 Extraction des composés phénoliques ................................................................................ 80 2.4 Calcul du Rendement ..................................................................................... 2.5 Détermination de l’activité antioxydante par le piegeage du radical libre DPPH .............. 81 2.6 Dosage des polyphénols totaux (PPT) ................................................................................ 81 2.7 Détermination de la teneur des Flavonoïdes totaux (FT).................................................... 82 2.8 Dosage des tanins condensés (TCT) ................................................................................... 2.9 L’analyse chromatographique HPLC-MS .......................................................................... 83 2.10 LC×LC Analysis ................................................................................................................. 83 2.11 Acquisition, traitement des données brutes LC et construction de modèles LDA ............. 84 3 Analyse Statistique ..................................................................................................................... 85 4 Résultats et discussion ................................................................................................................ 85 4.1 Résultats de rendement des extractions des composés phénoliques ................................... 85 4.2 Caractérisation des pennes et du pollen des différents cultivars du palmier dattier en termes de composés polyphénoliques ....................................................................................................... 88 4.2.1 Activité antioxydante piegeage du radical libre DPPH ........................................ 88 4.2.2 Polyphénols totaux ............................................................................................... 89 4.2.3 Flavonoïdes totaux ............................................................................................... 89 4.2.4 Tanins condensés.................................................................................................. 89 4.3 L'Analyse de Chromatographie liquide de haute performance (HPLC) ............................. 90 4.3.1 Choix des conditions de séparation LC×LC 4.3.2 Profils des fractions polyphénoliques des pennes de palmier-dattier de différents cultivars par LC×LC ..................................................................................... 4.3.3 Classification des pennes de palmier dattier en fonction de leurs cultivars à l'aide de LDA 99 5 Conclusion ..................................................................................... Etude III. Activité antibiotique ........................................................................................................ 103 1 Introduction .............................................................................................................................. 104 2 Matériel et méthodes ................................................................................................................ 105 2.1 Réactifs chimiques ............................................................................................................ 105 2.2 Matériel végétal ................................................................................................................ 106 2.3 Micro-organismes testés ................................................................................................... 107 2.4 Activité antibactérienne des extraits de plantes ................................................................ 107 2.4.1 Préparation des extraits et disques ..................................................................... 107 2.4.2 Analyse antibactérienne ..................................................................................... 2.4.3 Détermination de la concentration minimale inhibitrice (CMI) et de la concentration minimale bactéricide (CMB) 3 Analyse statistique.................................................................................................................... 112 4 Résultats et discussion .............................................................................................................. 112 4.1 Tests de diffusion sur disque ............................................................................................ 112 4.2 Détermination de CMI et CMB ..................................................................................... 5 Conclusion ..................................................................................... Conclusion générale et perspectives ..................................................................................... Références bibliographiques ........................................................................................................... 122 Annexes ............................................................................................................................................ 122 Résumé ………..…………………………………………………………………………………..151 Abstract ……………………………………………………...……………………………………...……..151 |
En ligne : | http://thesis.univ-biskra.dz/6091/1/1.%20th%C3%A9se%20Doctorat%20BENOUAMANE%20OURIDA%202023.pdf |
Exemplaires (1)
Cote | Support | Localisation | Disponibilité |
---|---|---|---|
DOC-AGR/72 | These doctorat | bibliotheque departement agronomie | disponible Disponible |